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滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的分子鉴别研究

文献类型: 中文期刊

作者: 尹利方 1 ; 陈泽斌 2 ; 夏体渊 2 ; 王定康 2 ; 姚丽媛 2 ; 华金珠 2 ; 徐胜光 2 ; 王家银 3 ;

作者机构: 1.昆明学院农学院;云南省高校生物炭工程研究中心;云南省农业科学院农业经济与信息研究所

2.;昆明学院农学院;云南省高校生物炭工程研究中心;云南省农业科学院农业经济与信息研究所

3.;昆明学院农学院;云南省高校生物炭工程研究中心;云南省农业科学院农业经济与信息研究所;

关键词: 滇池;沉积物;反硝化细菌;产甲烷菌;分子鉴别

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 154-159

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成。【方法】采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段。【结果】证实了滇池沉积物中存在反硝化细菌和产甲烷菌,且推测产甲烷菌的丰度高于反硝化细菌。2个克隆文库分别获得阳性克隆子55和99个,利用Mothur软件将序列分别划分为10和5个OUT,说明尽管反硝化细菌的丰度低于产甲烷菌,但物种多样性高于产甲烷菌。运用BLASTN程序在GenBank数据库中进行序列比对,发现55个反硝化细菌阳性克隆子可分为10个种类,OTU10类序列与细菌Dechloromonas aromatica的相似性达86%,是反硝化细菌中的优势类群;99个产甲烷菌阳性克隆子可分为5个种类,OTU5类序列与甲酸甲烷规则菌(Methanoregula formicicum)相似性达86%,该类群是反硝化细菌中的优势类群。【结论】滇池沉积物中的反硝化细菌与产甲烷菌多为潜在的未被培养的新种。

  • 相关文献

[1]滇池沉积物中厌氧氨氧化菌的分子生物学检测. 陈泽斌,任禛,夏体渊,王定康,陈兴位,林丽,靳松,徐胜光,华金珠. 2016

[2]滇池周边大棚土壤中六六六和滴滴涕残留特征. 尹可锁,张雪燕,徐汉虹,吴文伟,代雪芳,毛佳,洪丽芳. 2011

[3]滇池底泥堆场次生植被富集污染物调查. 王瀚墨,白涛,肖丹,何洁. 2011

[4]致病疫霉线粒体DNA单倍型的分子鉴别. 赵志坚,李先平,李成云,隋启君,RebeccaJ.Nelson,J.Soledad Gamboa. 2002

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