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马铃薯块茎不同发育时期转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 卢晓月 1 ; 李大伟 2 ; 邬倩 2 ; 祝光涛 1 ;

作者机构： 1.云南师范大学生命科学学院马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点实验室云南省高校马铃薯生物学重点实验室

2.岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所

关键词： 马铃薯;块茎发育;转录组;差异表达基因

期刊名称： 云南师范大学学报(自然科学版)

ISSN：

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 25-32

摘要： 为解析与薯块发育相关的关键基因,以马铃薯匍匐茎、薯块起始期和膨大期的薯块为材料进行转录组分析.结果显示:匍匐茎与薯块膨大起始期、薯块膨大起始期与膨大期比较分别筛选出759个和773个差异表达基因.基因本体分析显示这些基因主要富集到细胞过程、代谢过程和催化活性等生物学过程,代谢通路富集分析显示差异基因主要富集到能量代谢与碳水化合物代谢等途径,这些基因可能在块茎发育过程中的淀粉合成等途径起到关键作用.对富集到上述途径的基因结合转录组鉴定到了14个在薯块起始期上调表达的基因,利用实时荧光定量PCR验证了其中7个差异表达基因,发现其表达模式与转录组结果基本一致.

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