文献类型： 中文期刊

作者： 魏秀清 ¹ ; 李亮 ¹ ; 熊亚庆 ¹ ; 许玲 ¹ ; 章希娟 ¹ ; 陈志峰 ¹ ; 宋奇洁 ¹ ; 许家辉 ¹ ;

作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所

关键词： 百香果;SSR分子标记;品种鉴定;指纹图谱

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2022 年 010 期

页码： 1288-1297

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】基于SSR分子标记鉴别福建百香果品种的遗传多样性，构建福建百香果品种的分子指纹图谱。【方法】基于转录组测序，开发西番莲SSR分析标记，并筛选出15个重复性好、多态性高的分子标记用于17个福建百香果品种（系）鉴定及遗传多态性分析，构建百香果品种（系）的SSR分子指纹图谱。【结果】利用MISA软件对1 kb以上的24 319条西番莲（Passiflora caerulea L.） Unigene进行搜索，于8 742条Unigene上检测出11 385个SSR位点，出现频率为46.82%，平均分布距离为7.15 kb。单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸分别占总SSR的63.72%、20.40%和14.28%，为数量较大的优势重复基序，其优势重复基元分别为A/T、 AG/CT和AAG/CTT。通过Primer 3.0共获得出28 257对SSR引物。从26对有效扩增引物中选择重复性好的15对引物，对17份百香果品种（系）进行多态性验证分析。15对SSR引物共产生235条多态性条带，PIC平均值为0.95。利用UPGMA进行聚类分析并作图，在遗传距离0.765处，可将17个品种（系）分为7个类群。根据15对多态性引物扩增电泳图，选出PFSSR20和PFSSR29引物组合用于构建DNA指纹图谱，可鉴别出17个百香果品种（系）。【结论】利用西番莲转录组数据构建的SSR分子标记具有较高的多态性潜能，类型丰富，本研究基于此构建的DNA指纹图谱可分辨出17个百香果品种（系）。