文献类型: 中文期刊
作者: 高鑫文 1 ; 宋洪平 1 ; 王惠 1 ; 苗圃 1 ; 焦裕冰 1 ; 申莉莉 1 ; 王玉洁 1 ; 杨金广 1 ;
作者机构: 1.中国农业科学院烟草研究所
关键词: 本氏烟;马铃薯Y病毒;小 RNA测序;转录组测序
期刊名称:
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2025 年 46 卷 3 期
页码: 70-80
摘要:
为探究本氏烟响应马铃薯Y病毒(potato virus Y, PVY)侵染的分子机制,利用小RNA测序(small RNA sequencing, sRNA-seq)和转录组测序(RNA-seq)联合分析方法,研究本氏烟在PVY侵染后的tsRNAs和转录响应差异。结果显示,在PVY侵染后第7天,共鉴定出39种差异表达的tiRNAs(tRNA halves)和119种tRFs(tRNA-related fragments)。通过差异表达的靶基因(differentially expressed target genes, DETGs)富集分析,发现tRFs在叶片和茎中的117和602个靶基因主要富集在信号转导和能量代谢等通路中。其中,tDR-1:18-His-GTG-1-M3的表达在PVY侵染后的叶片中下调最为显著。在本氏烟中抑制tDR-1:18-His-GTG-1-M3的表达能显著提高其靶基因
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