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与番茄颈腐根腐病紧密连锁的SCAR标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 程琳 1 ; 张晓艳 2 ; 魏美甜 1 ; 伦尧尧 3 ; 赵静 4 ; 王晓武 5 ; 李传友 6 ;

作者机构: 1.农业农村部设施蔬菜种质创新重点实验室山东省设施蔬菜分子育种省级重点实验室山东省蔬菜工程技术研究中心山东寿光蔬菜种业集团有限公司山东省寿光蔬菜产业集团有限公司

2.寿光市农业技术中心

3.山东寿光欧亚特菜有限公司

4.山东省生物化学与分子生物学高校重点实验室潍坊学院生物与农业工程学院

5.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

6.中国科学院遗传与发育生物学研究所

关键词: 番茄;颈腐根腐病;SCAR标记;分子辅助育种

期刊名称: 中国蔬菜

ISSN: 1000-6346

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 36-42

收录情况: 北大核心

摘要: 利用与番茄颈腐根腐病抗性基因Frl紧密连锁的CAPS标记C2-25,开发设计了新的SCAR标记,用于快速检测Frl抗性材料。使用C2-25引物,在25份已知表型的番茄材料中进行PCR,产物单克隆测序后发现,19份纯合抗病材料存在1条完全相同的抗病序列;4份纯合感病材料存在1条完全相同的感病序列;2份杂合抗病材料均存在前述的抗病序列和感病序列。根据抗病、感病序列SNP差异设计引物,最终筛选得到可扩增出370 bp抗病特异片段和520 bp感病特异片段的番茄颈腐根腐病连锁标记R-6F/2R、S-3F/4R。在500株F2材料中进行验证,检测到122株纯合抗病单株、257株杂合抗病单株和121株纯合感病单株。F2材料人工接种鉴定结果显示,473株单株抗性与分子鉴定结果一致,分子标记辅助鉴定的准确率达到94.6%。开发的SCAR标记准确度高、成本低、操作简便,可用于Frl基因的分子标记辅助育种。

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