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双盲口线虫ITS rDNA的PCR扩增及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘梦婷 1 ; 李芬 1 ; 靳元春 1 ; 孙淼淼 2 ; 刘国华 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学动物医学院

2.中国农业科学院兰州兽医研究所 家畜疫病病原生物学国家重点实验室

关键词： 双盲口线虫;内转录间隔区(ITS);PCR扩增;序列分析

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2018 年 005 期

页码： 53-57

摘要： 以从波兰大西洋鳕体内采集的8条双盲口线虫样品为研究对象,利用保守引物通过PCR扩增其核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)ITS-1 rDNA、5.8S rDNA、ITS-2 rDNA后,将扩增片段纯化后克隆至pGEM-T Easy载体,经PCR及酶切鉴定后,对获得的阳性质粒DNA进行序列分析.结果显示,所获得的ITS rDNA及5.8S rDNA序列总长存在一定差异,ITS rDNA为885~927 bp,包含18S rDNA、28S rDNA部分序列及ITS-1 rDNA(441~449 bp)、5.8S rDNA(155 bp)和ITS-2 rDNA(266 bp)全部序列.结果表明,双盲口线虫ITS序列种内相对保守(ITS-1 rDNA:0~2.2%;ITS-2 rDNA:0~3.4%),而种间差异较大(ITS-1 rDNA>20%;ITS-2 rDNA>35%),可作为种间遗传变异研究的标记.本研究结果为双盲口线虫的分子鉴定、种群遗传学以及双盲口线虫病的进一步研究提供了参考和依据.

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