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水貂阿留申病毒微滴式数字PCR检测方法的建立与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王春霞 1 ; 商金源 1 ; 吴顺 1 ; 闫曼平 1 ; 冯二凯 1 ; 罗国良 1 ; 易立 1 ; 赵宗正 2 ; 高华 3 ; 于清平 4 ; 朱先鹏 5 ; 程悦宁 1 ; 王振军 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院特产研究所

2.军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所

3.通辽市科尔沁区动物疫病预防控制中心

4.通化县农业综合行政执法队

5.柳河县农业综合行政执法队

关键词: 水貂阿留申病毒;微滴式数字PCR;定量检测

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2024 年 46 卷 009 期

页码: 931-937

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立一种准确且灵敏的水貂阿留申病毒(AMDV)微滴式数字PCR检测方法(dd PCR),本研究根据AMDV-G基因保守区,设计特异性引物及探针,并对反应条件进行优化,初步建立检测AMDV的dd PCR方法。同时对该方法的特异性、敏感性和重复性进行分析。结果显示,dd PCR的退火温度为55℃,最佳引物和探针终浓度均为10μmol/μL。绘制的标准曲线结果显示,核酸标准物质稀释倍数的对数与对应检出拷贝数的对数之间呈良好的线性关系(R2=0.9945>0.99)。建立的dd PCR方法的特异性强,除能检测到AMDV以外,对相关病原如水貂犬瘟热病毒、犬细小病毒、貂肠炎病毒、犬冠状病毒、犬腺病毒I型、狂犬病毒的检测结果均为阴性。对AMDV核酸标准物质的检测限为6.2拷贝/μL,敏感性高,比荧光定量PCR(q PCR)敏感性高10倍。对不同稀释度AMDV核酸标准物质的批内和批间重复性试验的变异系数均<5%,重复性好。采用建立的dd PCR方法和荧光定量PCR方法对貂场采集的40份水貂脏器组织样品进行检测,两种检测结果基本一致,但dd PCR敏感性更高。上述结果表明,本研究建立了一种特异性强、灵敏度高、重复性好的AMDV定量检测方法,为水貂阿留申病毒的有效防控提供技术支持。

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