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2023年吉林省、山东省和内蒙古自治区三株鸭圆环病毒遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡静雷 1 ; 王笑焓 2 ; 王振军 3 ; 刘成 4 ; 何曼琳 2 ; 孙雍阳 2 ; 师少文 2 ; 任文浩 2 ; 王玉星 2 ; 聂小萱 2 ; 熊娜 1 ; 黄凯俊 1 ; 郭振东 2 ; 李楠 2 ; 赵宗正 2 ; 武军元 1 ;

作者机构: 1.塔里木大学动物科学与技术学院

2.中国农业科学院长春兽医研究所

3.中国农业科学院特产研究所农业部经济动物疫病重点实验室

4.聊城大学农学院

关键词: 鸭圆环病毒;遗传进化;序列分析

期刊名称: 特产研究

ISSN: 1001-4721

年卷期: 2025 年 47 卷 004 期

页码: 30-36,47

摘要: 为了解来自山东、内蒙古、吉林地区养殖场的3份鸭病料中鸭圆环病毒(Duck circovirus, DuCV)的遗传进化规律、基因型和变异情况。本研究运用DNAstar、RDP4、SimPlot、MEGA和BioEdit等软件对3株DuCV进行了同源性、重组、遗传进化、氨基酸突变和序列分析。通过分析发现,3株鸭圆环病毒的基因型均为鸭圆环病毒1型(DuCV-1),核苷酸同源性为99.20%~99.50%,与广东OR842550、广西OR134489和越南OM176553遗传距离最近且同源性最高。与2003年德国DuCV-1型代表株AY22855相比,3株鸭圆环病毒的Cap蛋白均发生了5个氨基酸突变,分别是R82Q,S106N,T107K,G194T,N236D。通过DNAstar对抗原表位预测分析,除了N236D突变,其余4个突变均位于DuCV的Cap蛋白的抗原表位区,可能会导致病原抗原漂移。同时发现2019年后报道的部分鸭圆环病毒Cap蛋白也出现了以上这5个氨基酸位点突变,表明这5个突变可能是DuCV进化过程中发生的固有突变。以上结果表明,2019年以后的部分DuCV的Cap蛋白发生5个固有变异,这些变异可能与鸭圆环病毒的抗原性、病毒毒力和致病性有关,同时也提示应当加强对DuCV的监测。

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