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黑龙江省2017年猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 霍琳琳 1 ; 李曦 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

关键词： 猪流行性腹泻病毒;黑龙江地区;S1基因;同源性;进化树;抗原表位

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 77-83+86

收录情况： 北大核心

摘要： 为了监测黑龙江省猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行及遗传进化情况,试验采用RT-PCR方法对2017年采集到的黑龙江地区猪场腹泻样品进行了PEDV检测,并对PEDV阳性样品进行S1基因测序及遗传演化分析。结果表明:试验成功获得6条PEDV S1基因序列,6株毒株S1基因之间核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为97.8%～100%和96.7%～100%,与国内外近5年分离毒株S1基因核苷酸序列的同源性分别为89.9%～100%和90.7%～100%,与国内外近5年分离毒株S1基因氨基酸序列的同源性分别为88.3%～98.8%和88.0%～97.8%,与传统疫苗株CV777 S1基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为90.4%～91.0%和89.3%～90.4%。6株毒株均属于GⅡ型,与近年来广泛流行于我国养猪场并造成严重经济损失的毒株属于同一基因型,与传统疫苗株CV777分属于不同亚群。6株毒株的氨基酸变化主要发生在第一个抗原表位,即499～638位氨基酸上。说明黑龙江地区养猪场猪群中仍然存在PEDV的传播和感染,且与商品化的疫苗毒株相比基因变异明显。

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