玉米农艺性状配合力全基因组关联分析和预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马娟

作者： 马娟;刘京宝;朱卫红;黄璐;宇婷;乔江方

作者机构：

关键词： 一般配合力;多位点全基因组关联分析;基因组选择

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 944-956

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 一般配合力（GCA）是评价亲本自交系利用价值的一个重要指标。为解析玉米配合力遗传机理，以NCII遗传交配设计获得的537份杂交组合为材料，结合玉米5.5K液相育种芯片的11 734个高质量单核苷酸多态性（SNP）标记，采用7种多位点全基因组关联分析（MGWAS）方法挖掘新乡、周口和综合环境穗行数、粒长和粒宽GCA显著关联位点，并在MGWAS研究基础上利用5种基因组选择方法对GCA效应开展预测研究。结果表明，共检测到46个SNPs与穗行数以及2个籽粒性状GCA显著关联（P＜8.52×10-7），其中10个位点被2～5种MGWAS方法同时检测到，8个SNPs被至少2个环境共定位。6个SNPs（1＿43440622、2＿69742504、2＿71037706、2＿197716855、5＿219239213和8＿134634317）为环境稳定和MGWAS方法稳定重叠的位点，是控制穗行数和籽粒性状GCA效应的重要位点。穗行数和粒宽GCA利用5种随机效应模型取得较高的预测准确性，为0.62～0.74，粒长GCA基因组预测精度较低，为0.28～0.45。3个环境中，多数情况下将不同MGWAS挖掘的显著SNPs作为固定效应加入最佳线性无偏估预测（GBLUP）和再生核希尔伯特空间（RKHS）会提高穗行数和2个籽粒性状GCA的预测准确性，穗行数和粒宽的提高率为0.66%～15.96%，粒长的提高率为9.26%～83.05%。本研究结果为后续基因功能验证以及关键位点的基因组选择辅助育种提供了重要基因信息和技术指导。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]玉米穗长一般配合力多位点全基因组关联分析和预测. 马娟,朱卫红,刘京宝,宇婷,黄璐,郭国俊. 2023

[2]高粱千粒重全基因组关联分析和候选基因预测. 邹桂花1,丁延庆2,徐建霞2,曹宁2,陈合云1,刘合芹1,郑学强1,张立异2. 2022

[3]畜禽基因组选择的研究进展. 李娅兰,瞿浩,苏国生,舒鼎铭. 2010

[4]基因组选择及其在作物育种中的应用. 陈雨,姜淑琴,孙炳蕊,潘大建,范芝兰,陈文丰,李晨. 2017

[5]家禽基因组选择研究进展. 刘天飞,瞿浩,王劼,舒鼎铭. 2014

[6]基因组选择及其在猪育种中的应用. 李娅兰,梅盈洁,刘敬顺,杨明,王青来,吴珍芳. 2012

[7]西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测. 齐欣,张静静,樊惠中,李娟,胡鑫,刘飞,朱波,高雪,陈燕. 2016

[8]新西兰苹果品种及苹果砧木育种成就与启示. 张恒涛,BUSVincentG.M.,WHITEAllan,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAOJia-long,CHAGNéDavid. 2016

[9]中国种业科技创新的智能时代——“玉米育种4.0”. 王向峰,才卓. 2019

[10]新西兰苹果品种及砧木育种成就与对中国的启示. 张恒涛,BUSVincent G·M·,WHITEAllan G·,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAO Jia-long,CHAGNé David. 2016

[11]基因组选择及其应用. 李恒德,包振民,孙效文. 2011

[12]分子遗传技术在家畜遗传评定中的应用. 狄江,王琼,拉扎提. 2009

[13]林木植物的全基因组选择. 田郎. 2015

[14]畜禽基因组选择中贝叶斯方法及其参数优化策略. 朱波,王延晖,牛红,陈燕,张路培,高会江,高雪,李俊雅,孙少华. 2014

[15]基因组选择在羊育种中的应用研究进展. 张统雨,魏霞,张勤,杜立新,王立贤,赵福平. 2018

[16]燕麦分子育种研究进展. 吴斌,郑殿升,严威凯,申状状,晏林,张宗文. 2019

[17]基因组选择方法研究进展. 王欣,孙辉,胡中立,徐辰武. 2018

[18]基因组选择育种探讨. 吴建忠. 2022

[19]对比Bayesian B等多种方法的大豆全基因组选择应用研究. 唐友,郑萍,王嘉博,张继成. 2018

[20]畜禽基因组选择方法研究进展. 鲍晶晶,张莉. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序