大豆荚粒数相关QTL的Meta和Overview分析及其候选基因预测
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李莹莹
作者: 李莹莹;李瑞超;程春光;赵圆圆;刘春燕;齐照明;李灿东;王囡囡;蒋洪蔚;陈庆山
作者机构:
关键词: 大豆;荚粒性状;Meta分析;Overview分析;候选基因
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN: 1674-7968
年卷期: 2018 年 11 期
页码: 1821-1833
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 荚粒性状与大豆(Glycine max)产量密切相关。本研究利用完备区间作图法(inclusive composite interval mapping, ICIM)对两年的重组自交系(recombinant inbred line, RIL)群体数据进行分析,获得7个与荚粒性状相关的数量性状基因座(quantitative trait loci, QTL),并搜集了国内外已报道的154个荚粒性状相关QTLs。利用元分析(Meta-analysis)方法得到23个Meta-QTL区间,利用基于统计学原理的Overview方法对这些QTL区间进行优化。经Overview分析,获得13个有效的QTL区间,5个QTL区间被缩小到0.5 Mb。对Meta-QTL区间进行基因注释,获得687个基因,筛选11个基因作为候选基因。11个候选基因参与植物生长发育、果实成熟等过程。本研究建立的实验方法及研究结果,对于大豆荚粒性状QTL定位及分子辅助育种提供了基础资料。
分类号: S565.1
- 相关文献
[1]大豆倒伏性相关QTL的整合及Overview分析. 刘硕,郭勇,罗玲,邱丽娟. 2013
[2]大豆株高QTL的“整合”及Overview分析. 高利芳,郭勇,郝再彬,邱丽娟. 2013
[3]大豆倒伏性相关QTL的整合及Overview分析. 刘硕,郭勇,罗玲,邱丽娟. 2014
[4]大豆荚粒性状的QTL分析. 张维耀,王金星,宗春美,付春旭,王茂青,孙艳杰,胡国华,陈庆山. 2012
[5]不同环境下大豆荚粒性状的遗传与QTL分析. 梁慧珍,余永亮,杨红旗,张海洋,董薇,李彩云,巩鹏涛,刘学义,方宣钧. 2012
[6]大豆重组自交系群体荚粒性状的QTL分析. 王贤智,张晓娟,周蓉,沙爱华,吴学军,蔡淑平,邱德珍,周新安. 2007
[7]大豆种质资源叶型和荚粒性状的关系及与SSR标记的关联分析. 伍宝朵,陈海峰,郭丹丹,沙爱华,单志慧,张晓娟,杨中路,邱德珍,陈水莲,朱晓玲,张婵娟,周蓉,周新安. 2012
[8]基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位. 齐照明,孙亚男,陈立君,郭强,刘春燕,胡国华,陈庆山. 2009
[9]大豆共生结瘤相关性状QTL定位信息整合及候选基因分析. 张艳娇,李长育,王锦辉,常慧琳,魏玮,马超,姜志浩,蒋洪蔚,刘春燕,尹振功,高山,金喜军,辛大伟,陈庆山. 2017
[10]施用钼肥对大豆生长性状、产量和品质影响的Meta分析. 张立强,张景勇,孙宇,贺斌斌,张伟,陈迪,朴仁哲,赵洪颜. 2022
[11]大豆根长QTL的Meta分析及候选基因挖掘. 刘鑫,甄善继,王家军,王洋. 2023
[12]大豆籽粒蛋白质含量分子遗传研究进展. 魏荷,王金社,卢为国. 2015
[13]基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析. 邱红梅,厉志,于妍,高淑芹,马晓萍,郑宇宏,孟凡凡,侯云龙,王跃强. 2015
[14]不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析. 宋晓宇,毛婷婷,王立伟,刘丽凤,李晓那,孙石,韩天富. 2018
[15]大豆分枝数相关分子标记开发及qBN-18位点精细定位. 吴海涛,张勇,苏伯鸿,Lamlom F Sobhi,邱丽娟. 2020
[16]栽培大豆×半野生大豆高密度遗传图谱构建及株高QTL定位. 于春淼,张勇,王好让,杨兴勇,董全中,薛红,张明明,李微微,王磊,胡凯凤,谷勇哲,邱丽娟. 2022
[17]大豆株高QTL定位及候选基因挖掘. 郑海洋,侯立龙,曹富斌,魏茹茹,谢建国,蒋洪蔚,陈庆山. 2023
[18]基于BSA-Seq技术鉴定大豆耐荫性状相关候选基因. 曾维英,苏燕竹,赖振光,杨守臻,陈怀珠,谭玉荣,孙祖东,盖钧镒. 2021
[19]基于高密度Bin图谱的大豆百粒重QTL定位和候选基因分析. 葛天丽,田宇,张皓,刘章雄,李英慧,邱丽娟. 2022
[20]大豆R6期籽粒氨基酸含量的全基因组关联分析. 张红梅,熊雅文,许文静,张威,王琼,刘晓庆,刘慧,崔晓艳,陈新,陈华涛. 2023
作者其他论文 更多>>
-
大豆新品种佳豆55的选育
作者:张振宇;王志新;郑伟;李灿东;郑天琪;吴秀红;李志民;李增杰
关键词:大豆;新品种;佳豆55;栽培技术
-
合农71高产创建关键技术
作者:郭美玲;郭泰;高中奎;宫秀英;王志新;郑伟;李灿东;盖志佳
关键词:合农71;高产创建;关键技术
-
根菜类作物块根测定装置的研制
作者:张春峰;刘军亮;王囡囡;朱宝国;孟庆英;冯浩原
关键词:根菜;块根;甜菜;测定装置;研制
-
基于共线性分析的大豆种子硬实性QTL定位及候选基因预测
作者:马迅通;吉彪;马占洲;董晓慧;韩思宁;韩留阳;李旭;刘佳瑞;张钰;冯学珍;张煦杭;黄亚娸;陈庆山;齐照明;武小霞
关键词:大豆;种子硬实;QTL定位;共线性分析
-
大豆重迎茬问题及与玉米轮作大豆季整地技术综述
作者:郭美玲;郭泰;王志新;郑伟;李灿东;徐杰飞;赵星棋;王象然
关键词:大豆;重迎茬;玉米;轮作;大豆季;整地技术
-
合丰(合交、合农、佳豆)号系列大豆品种的亲本分析
作者:郭美玲;郭泰;刘忠堂;王志新;郑伟;李灿东;徐杰飞;赵星棋
关键词:合丰(合交、合农、佳豆)系列;大豆品种;亲本分析
-
超早熟大豆新品种佳豆59的选育与栽培技术
作者:徐杰飞;郭泰;王志新;郑伟;李灿东;赵海红;赵星棋;郭美玲
关键词:佳豆59;大豆新品种;超早熟;选育;栽培技术