基于共线性分析的大豆种子硬实性QTL定位及候选基因预测

文献类型: 中文期刊

第一作者: 马迅通

作者: 马迅通;吉彪;马占洲;董晓慧;韩思宁;韩留阳;李旭;刘佳瑞;张钰;冯学珍;张煦杭;黄亚娸;陈庆山;齐照明;武小霞

作者机构:

关键词: 大豆;种子硬实;QTL定位;共线性分析

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 293-300

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 大豆种子硬实度关乎食品与饲料加工。为提高大豆种子硬实度分子标记辅助选择的效率,发现相关候选基因,利用染色体片段代换系(chromosome segment substitution lines, CSSL)对大豆种子硬实性进行了两年的QTL定位研究,结合前人得到的25个种子硬实性QTL,利用MCScanX对整个大豆基因组进行分析,生成共线性区组,评估大豆种子硬实性QTL之间的共线性,确定了位于Gm02片段的中心QTL。利用多个数据库分析hub-QTL区段的基因,锚定了8个与大豆种子硬实性相关的候选基因。从CSSL群体中选择种子硬实性不同的两个品系和轮回亲本,用于随后的实时荧光定量PCR分析,发现候选基因Glyma.02G269400和Glyma.02G269500在CSSL群体中硬实性不同的2个品系及轮回亲本绥农14中的表达差异显著。Glyma.02G262600在绥农14中的相对表达量约是CSSL-136的5倍,而在CSSL-200中表达量中等,推测该基因抑制大豆种皮的形成。

分类号: S565.1

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