大白菜BraHHP基因家族鉴定及在不同光周期处理下的表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周麟笔
作者: 周麟笔;马关鹏;杨巍;刘炼;刘峰;赵大芹
作者机构:
关键词: 大白菜;BraHHP基因家族;光周期;基因表达
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 011 期
页码: 3488-3497
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: Heptahelical protein (HHP)转录因子家族在调节植物响应低温、盐害和激素处理等非生物胁迫中起着重要作用。生物钟能调控植物体的基因表达,光是调节植物生物钟,使植物与环境变化相适应的一个关键信号,然而对于HHP基因家族如何响应光信号的研究还鲜有报道。本研究利用生物信息学手段对大白菜BraHHP基因家族成员进行鉴定分析,并通过RT-qPCR方法,对BraHHP基因家族在不同光周期条件下的表达模式进行研究。本研究一共从大白菜基因组中鉴定出9个BraHHP基因,聚类在3个亚族中,BraHHP蛋白家族的氨基酸长度在323~387 aa,分子量在36.91~44.49 kD,所有蛋白成员均含有1个HlyⅢ保守结构域。另外,荧光定量结果表明,不同BraHHP基因在长日照(16 h光照/8 h黑暗)处理下的表达模式非常一致;在中日照(12 h光照/12 h黑暗)处理下,不同BraHHP基因之间的表达模式不尽相同;在短日照(8 h光照/16 h黑暗)处理下,除BraHHP2-2外,其他BraHHP基因的表达模式基本一致。本研究初步明晰了大白菜BraHHP基因家族对不同光周期的适应性反应,为进一步解析BraHHP基因家族的生物学功能提供了思路。
分类号: S634.1
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