出芽短梗霉菌株PA-2侵染藜叶片的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晓芳

作者： 刘晓芳;杨莹;高汉峰;程亮;朱海霞;郭青云

作者机构：

关键词： 出芽短梗霉菌株PA-2;藜;转录组分析;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1521-1534

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 藜（Chenopodium album）是一种极具竞争力的一年生世界性杂草。为了探究出芽短梗霉（Aureobasidium pullulans）菌株PA-2侵染藜的分子机制，利用RAN-seq技术分析PA-2侵染藜叶片0 （CK）、1 （T1）、3 （T3）、5（T5）、7 （T7） d的转录组差异。基于转录组数据组装，共得到69 404条Unigene，其中50.13%的序列在KEGG、NR、COG以及SwissProt四大数据库中得到注释。利用GO数据库对差异表达基因进行分析，结果发现差异表达基因主要富集在质体、类囊体、叶绿体、细胞膜以及氧化还原酶活性等方面。利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现，PA-2侵染主要影响了植物MAPK信号通路、植物病原体相互作用、苯丙烷生物合成和植物激素信号转导等途径中关键基因的表达水平。经PA-2处理后，通过转录组测序筛选出与叶绿体相关的差异基因主要集中在光系统Ⅱ（PSⅡ），分别是psbY、psbB以及psbO基因，其次是与碳固定过程紧密相关的3-磷酸甘油醛脱氢酶（GAPB）和果糖二磷酸醛缩酶（FBA3）的基因，影响叶绿体膜流动性的乙酰辅酶A羧化酶（BCCP1）以及影响可溶性糖含量的葡聚糖水二激酶（GWD1）。研究结果初步明确了菌株PA-2防除藜的分子机制，为PA-2生物除草制剂商品化以及杂草的生物防治奠定一定的理论基础。

分类号： S451

  • 相关文献

[1]旱柳转录组测序及生物学分析. 李敏,郭聪,李玉娟,冯新民,王莹,张健,谈峰. 2019

[2]利用转录组分析茉莉酸甲酯对金针菇原基生长的影响. 李玉,朱秋瑾,李巧珍,陆欢,王瑞娟,杨慧,尚晓冬,刘建雨. 2022

[3]'枸头'橙针刺和枝的转录组分析. 孙立方,柯甫志,聂振朋,王平,孙建华,黄秀,徐建国. 2020

[4]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020

[5]高粱窄叶突变体nal1表型鉴定及转录组分析. 刚爽,张世睿,陆晓春,高梽鑫,李金红. 2023

[6]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021

[7]睡莲叶片胎生发育转录组分析. 苏群,田敏,李春牛,李先民,卢家仕,黄展文,李杰梅,卜朝阳,王虹妍. 2021

[8]甘肃省景泰县胡麻田杂草发生消长规律研究. 李玉奇,刘敏艳,胡冠芳,牛树君,胡广瑜. 2012

[9]解除藜种子休眠的方法研究. 张建华,董良利,曹昌林,史丽娟,彭之东,范娜,李光,郭瑞峰,白文斌. 2015

[10]氮、磷对黄顶菊和藜竞争的影响机制研究. 杨晴,郭建英,万方浩. 2010

[11]春小麦田藜和野燕麦生态经济阈值模型的初步研究. 白全江,程玉臣,赵存才,李子钦,张力军,赵文先. 2000

[12]三种杂草对草甘膦的敏感性及处理后植株体内莽草酸积累量差异. 张朝贤,黄红娟,魏守辉,张猛,郭峰. 2011

[13]藜、铁苋菜和苘麻对草甘膦的耐受性及其与莽草酸含量的关系. 李香菊. 2016

[14]草地螟选择大画眉草而非藜产卵的证据及原因. 罗礼智,潘贤丽,康爱国. 2010

[15]胡麻苗期阔叶杂草藜高效防除药剂田间筛选. 赵峰,胡冠芳,牛树君,王玉灵,李玉奇. 2018

[16]玉米田两种阔叶杂草苍耳和藜对草铵膦敏感性测定. 贾芳,陈景超,崔海兰,李香菊,谢家建,于惠林. 2021

[17]玉米氮素敏感性差异自交系的表达谱分析. 葛敏,吕远大,张体付,周玲,林峰,赵涵. 2016

[18]花椰菜温敏雄性不育系GS-19花药败育的细胞学及转录组分析. 陶兴林,侯栋,朱惠霞,刘明霞,张金文,胡立敏. 2017

[19]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015

[20]第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析. 柏斌,吴俊,邓启云,周波. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序