华南地区牛结节性皮肤病病毒全基因组测序及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周秀蓉
作者: 周秀蓉;黄敏霞;徐志宏;温肖会;罗胜军;贾春玲;高原;翟颀;吕殿红
作者机构:
关键词: 华南地区;牛结节性皮肤病病毒;全基因组测序
期刊名称: 中国兽医学报
ISSN: 1005-4545
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 260-268
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了对2020年我国华南地区牛结节性皮肤病(lumpy skin disease, LSD)疫情进行溯源调查,本研究采用商品化检测试剂盒和透射电镜对2份华南地区疑似感染的牛皮肤结节组织样本进行鉴定,利用高通量测序技术进行病毒全基因组测序,并对其进行序列比对、遗传进化和病毒重组分析。qPCR检测结果显示2份样本均为牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus, LSDV)阳性,电镜观察到典型LSDV病毒粒子形态,将其命名为China/GD02/2020株和China/GX01/2020株,获得全基因组序列上传GenBank获得登录号分别为OM803091和OM803092。对病毒全基因组序列比对及遗传进化分析显示GD02和GX01株的核苷酸相似性达到99.99%,并与2020年中国台湾、中国香港和越南的LSDV分离株处于进化树的同一小分支,且均归属为重组病毒。病毒重组分析表明2株病毒的主要亲本为南非疫苗株(Neethling vaccine LW 1959),次要亲本为摩洛哥从牛分离的田间株(LSD/KSGP 0240/Morocco/2017)和南非野毒株(Neethling Warmbaths LW)等。本研究对国内LSDV流行毒株的遗传演化、溯源和防控具有借鉴意义。
分类号: S852.65
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