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线粒体COI基因条形码在鲿科鱼类物种鉴定中的应用

文献类型： 中文期刊

作者： 梁宏伟 1 ; 孟彦 1 ; 罗相忠 1 ; 李忠 1 ; 邹桂伟 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所;农业农村部水生动物基因组学重点实验室

关键词： 鲿科;DNA条形码;COI基因;物种鉴定;系统发育

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 772-782

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探讨线粒体COI基因作为DNA条形码在中国鲿科(Bagridae)鱼类物种鉴定中的有效性,以及系统发育中的适用性,本研究对4属11种鲿科鱼类进行PCR扩增,获得48条线粒体COI基因序列,同时从Gen Bank筛选获得8种鲿科鱼类的12条COI基因序列进行分析。19种鲿科鱼类的COI基因序列特征显示:长度为674 bp的COI序列片段平均碱基组成为24.82%A,30.44%T,27.10%C和17.64%G,碱基组成呈现明显的AT偏倚性(55.26%),具有硬骨鱼类的线粒体COI基因的碱基组成的典型特征。核苷酸位点中有变异位点226个,简约信息位点195个,单一信息位点31个,转换颠换比为3.35。19种鲿科鱼类的种内、种间和属间平均遗传距离分别为0.0041、0.1136和0.1268,种间遗传距离平均为种内遗传距离的27.7倍。在本研究中,鲿科鱼类所有的物种均形成单系,在物种鉴别上与形态学分类结果基本一致,然而鲿科的4个属中只有鱯属形成单系,黄颡鱼属、属和拟鲿属均未形成单系,其进化地位需要进一步研究。线粒体COI基因作为条形码可有效对鲿科鱼类进行物种鉴定,也为鲿科的系统发育提供了参考。

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