您好,欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库!

甘蔗新基因ShUGT2的生物信息学分析及亚细胞定位

文献类型: 中文期刊

作者: 李延博 1 ; 王俊刚 2 ; 赵婷婷 2 ; 张树珍 2 ; 熊国如 2 ;

作者机构: 1.海南大学园艺学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/中国热带农业科学院甘蔗研究中心/海南省南繁生物安全与分子育种重点实验室

关键词: 甘蔗;UDP-糖基转移酶;基因克隆;生物信息学分析;亚细胞定位

期刊名称: 热带农业科学

ISSN: 1009-2196

年卷期: 2021 年 41 卷 005 期

页码: 25-32

摘要: UDP-糖基转移酶在植物体内负责糖基化修饰,对植物的生长发育起着关键作用.以甘蔗品种ROC22为供试材料,提取成熟叶片总RNA并反转录合成cDNA,经PCR扩增获得ShUGT2基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学、亚细胞定位和组织特异性表达分析.结果表明:ShUGT2含有1782 bp的完整开放阅读框,编码593个氨基酸,其编码蛋白与高粱UDP-糖基转移酶同源性达到92.45%.ShUGT2编码蛋白不稳定系数为48.68,疏水性指数-0.338,是一种亲水性蛋白;在20~42个氨基酸的位置,有一个跨膜区;在309~514个氨基酸,存在UDP-糖基转移酶的家族特异保守结构域,属于GT8家族成员,其功能是通过合成木聚糖,调控细胞内半纤维素成分,维持植物的生长发育.亚细胞定位分析表明,ShUGT2编码蛋白定位于线粒体;在甘蔗的根、茎、叶组织中,ShUGT2基因均有表达,与甘蔗的生长发育密切相关.本研究结果为进一步分析ShUGT2基因功能提供了科学依据.

  • 相关文献
作者其他论文 更多>>