文献类型: 中文期刊
作者: 钱玉磊 1 ; 闫晋强 1 ; 刘文睿 1 ; 吴智明 2 ; 谢大森 1 ; 江彪 1 ;
作者机构: 1.广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室
2.仲恺农业工程学院园艺园林学院
关键词: 葫芦科;OXR基因;保守结构域;顺式作用元件;生物信息学;表达谱;亲缘关系
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2023 年 008 期
页码: 51-61
收录情况: 北大核心
摘要: 抗氧化(oxidation resistance, OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因,能有效清除活性氧,在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库,从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员,其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员,南瓜有7个成员。通过系统发育以及保守结构域分析,将这些OXR成员分为5个亚族:OXR1、OXR2、OXR3、OXR4和OXR5。OXR基因在染色体上呈不均匀分布,同一亚族OXR成员所编码的氨基酸数、分子量、外显子数、内含子数以及保守基序的排列模式都极为相似,表明OXR基因具有高度保守性。顺式作用元件分析结果显示,OXR基因的启动子区域含有多种顺式作用元件以及MYB转录因子的结合位点。基因复制分析发现,葫芦科OXR2成员通过片段复制或全基因组复制发生了一定扩张,这些复制基因对均受到纯化选择。共线性分析结果显示,在亲缘关系较近的葫芦科作物之间,OXR基因所在的共线性区块较大。不同组织的表达谱分析结果显示,葫芦科OXR4成员有相似的表达模式,在叶片中表达量均较高;OXR2亚族内复制基因出现了非对称表达的现象。
- 相关文献
[1]玫烟色棒束孢诱导的小菜蛾免疫响应表达谱分析. 雷妍圆,何余容,谢梅琼,吕利华,顾家睿. 2016
[2]水稻(Oryzasativa L.)潜在内源性致敏原的生物信息学筛选与分析. 朱方超,贾瑞宗,徐林,郭运玲,孔华. 2015
[3]基于ITS序列探讨空心瓜在葫芦科中的系统分类. 江彪,刘文睿,何晓明,彭庆务,林毓娥,梁肇均,谢大森. 2016
[4]利用黄瓜、甜瓜和西瓜SSR开发葫芦科作物穿梭标记. 刘鹏,吴海滨,龚浩,何晓莉,邓国栋. 2014
[5]葫芦科作物果实糖积累及其调控研究进展. 王曼曼,屈淑平,李俊星,吴廷全,黄河勋,钟玉娟. 2019
[6]花生ARAhPR10基因启动子序列的克隆及分析. 温世杰,谢纯政,李玲,刘海燕,梁炫强. 2012
[7]花生AhDRRP基因启动子的克隆. 钟旎,李万福,梁炫强. 2011
[8]大豆耐胁迫相关蛋白编码基因GmSAMDC1的克隆及表达分析. 任锐,杨凤玺,王涛,高乐,智海剑,李凯. 2018
[9]荔枝蒂蛀虫信息素结合蛋白基因序列及表达分析. 李鹏燕,刘艳萍,王思威,孙海滨,柏建山,彭刚,龚雪海. 2018
[10]大花蕙兰种质资源亲缘关系的RAPD分析. 李冬梅,叶庆生,朱根发. 2007
[11]汝城白毛茶与两广主要“白毛茶”居群亲缘关系的RAPD分析. 黎星辉,施兆鹏,刘春林,罗军武,沈程文,李家贤,方华春. 2002
[12]茄子及其近缘野生种遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析. 廖毅,孙保娟,黎振兴,罗少波,陈日远,孙光闻,李植良. 2009
[13]我国热带山地稻种类缘的探讨. 钱咏文,刘钧赞,何昆明,李万光. 1988
[14]龙眼品种(系)遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析. 易干军,谭卫萍,霍合强,张秋明,李建光,周碧容. 2003
[15]香蕉种质遗传多样性与亲缘关系的AFLP分析. 谭卫萍,张秋明,于晓英,曾继吾,黄秉智,易干军. 2010
[16]墨兰“达摩”芽变叶艺品种亲缘关系的RAPD分析. 李冬梅,朱根发,叶庆生. 2007
[17]豇豆种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP和SSR分析. 刘凯,陈汉才,李桂花,张艳,黎庭耀,罗少波,李明珠. 2014
[18]4个优质高产水稻品种的系谱分析. 徐炎康,谢文青,陈俊聪,黄洪华. 2006
[19]花生青枯病抗性鉴定及抗源分析. 周桂元,梁炫强,李一聪,李少雄. 2003
[20]菠萝种质鉴定及亲缘关系的AFLP分析. 刘卫国,易干军,刘岩,张秋明,曾继吾. 2008
作者其他论文 更多>>
-
植物激素对冬瓜外观及内在品质相关基因表达的影响
作者:薛舒丹;万小童;钟玉娟;吴玉娟;陆森;刘展舒;傅曼琴;谢大森
关键词:外源激素;冬瓜;外观品质;风味品质;营养品质;相关基因表达
-
冬瓜首雌花节位遗传分析与基因定位
作者:王敏;刘微;谢大森;江彪;闫晋强;彭庆务;何晓明;杨松光;刘文睿
关键词:冬瓜;首雌花节位;遗传分析;基因定位;候选基因
-
嫁接和施氮量对冬瓜干物质、氮素积累及其氮代谢酶的影响
作者:廖道龙;云天海;刘子凡;伍壮生;黄项心兰;陈贻诵;谢大森
关键词:冬瓜;施氮水平;嫁接栽培;氮素累积量;干物质累积量;氮代谢酶
-
不同芥菜品种对发酵泡菜品质的影响规律
作者:罗文珊;张艳;徐玉娟;江彪;余元善;傅曼琴;李璐
关键词:芥菜;发酵;泡菜;品质;挥发性物质
-
节瓜CqWRKY31的互作蛋白筛选与鉴定
作者:闫晋强;王敏;彭庆务;刘文睿;江彪;谢大森;何晓明
关键词:节瓜;枯萎病;CqWRKY31;酵母双杂交;互作蛋白
-
辣椒DNA甲基化修饰酶基因的鉴定与表达特征分析
作者:张颖;蔡小桃;谢炳春;韦丽丽;徐小万;张碧佩;吴智明
关键词:辣椒;DNA甲基化;果实发育;非生物胁迫;表达分析
-
黑皮冬瓜干物质和养分吸收与分配的动态规律
作者:焦加斌;陈晓东;郑朝元;陈潇;常静静;宋钊;谢大森;何裕志;张白鸽
关键词:黑皮冬瓜;干物质;养分吸收;养分分配;动态规律