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上海地区猪萨佩罗病毒的检测及遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李本强 1 ; 刘惠莉 1 ; 刘佳佳 1 ; 陶洁 1 ; 程靖华 1 ; 石迎 1 ; 乔长涛 1 ; 沈晓晖 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所∕上海市农业遗传育种重点实验室

关键词: 猪萨佩罗病毒分离株;流行病学调查;VP1基因;遗传进化分析

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2023 年 39 卷 002 期

页码: 64-70

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了明确猪萨佩罗病毒在仔猪腹泻病情中的作用,2016-2020 年采集上海市及周边 11 个猪场腹泻病料,共计1446 份.利用RT-PCR方法对其进行PSV筛检,并对阳性样品进行病原分离及病毒特性研究.结果显示:共筛检出256 份PSV核酸阳性样品,阳性率17.7%.从阳性样品中成功分离到2 株PSV病毒,全基因序列遗传进化分析显示2 株PSV分离株聚集在中国PSV毒株集群上,分离株在3D区域4696-5945 bp处存在重组区域.病毒核苷酸分析发现中国PSV毒株与韩国PSV毒株核苷酸相似性为 87%—88.5%,与欧洲PSV毒株核苷酸相似性为84.9%—87.3%.对VP1 基因氨基酸序列分析发现分离株与参考株存在氨基酸位点突变,中间氨基酸序列保守,无突变及插入和缺少现象.PSV分离株与参考株均含有173 位潜在糖基化位点,VP1 蛋白分子表面抗原表位分布均匀.该研究可为猪萨佩罗病毒病原学及其疫苗的研制奠定基础.

  • 相关文献

[1]PEDV流行株的分离鉴定及其遗传进化分析. 陶洁,熊年年,张春玲,李本强,孟丽. 2016

[2]猪7种腹泻相关病毒的临床检测及猪嵴病毒的遗传进化分析. 孟丽,陶洁,李本强,马玉飞,程靖华,张春玲,刘惠莉. 2017

[3]上海郊区猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查. 周佳明,陈冈,司伏生,于瑞嵩,陈冰清,谢春芳,李震,董世娟. 2022

[4]猪圆环病毒2型和3型混合感染与遗传进化分析. 孙莹慧,夏叶,陈鹏飞,缪德年. 2023

[5]猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析. 李本强,陶洁,程靖华,石迎,乔长涛,刘惠莉. 2021

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