文献类型: 中文期刊
作者: 田守波 1 ; 吴珏 2 ; 胡家阳 2 ; 陶赛峰 2 ; 汪宽鸿 1 ; 杨晓峰 1 ; 陈春宏 1 ; 张兆辉 1 ;
作者机构: 1.上海市农业科学院设施园艺研究所
2.上海市奉贤区农业技术推广中心
关键词: 瓠瓜(Lagenaria siceraria);MYB家族;白粉病菌;表达模式
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 021 期
页码: 6982-6997
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了探讨瓠瓜(Lagenaria siceraria) MYB转录因子家族的功能,本研究基于瓠瓜的全基因组和白粉病菌侵染后的转录组数据,利用生物信息学软件对Ls MYB家族成员进行了鉴定、分析。结果表明:在瓠瓜全基因组中共鉴定到174个LsMYBs基因,其氨基酸数为103~1 673个,均为亲水性蛋白;亚细胞定位预测表明,118个LsMYB基因定位在细胞核中;根据MYB结构域重复数,可将瓠瓜MYB分为1R、2R (R2R3)、3R三个类型,其中2R类型和1R类型分别占比51.1%、47.7%;进化树分析显示,瓠瓜MYB基因家族可被分成31个亚组,推测相同亚组上的瓠瓜与拟南芥的MYB转录因子可能具有相似的功能;利用MEME软件预测得到15个motif元件,分析发现不同MYB的motif数量及分布存在一定差异,同一亚组MYB蛋白具有相似的结构特征;顺式作用元件表明,LsMYB基因启动子区域包含光响应、激素应答、生物及非生物胁迫等相关作用元件和结合位点,表明瓠瓜MYB基因家族可能广泛参与了瓠瓜的生长发育、激素调控、生物/非生物胁迫的响应;瓠瓜接种白粉病菌后MYB家族成员表达量分析表明,推测与抗白粉病相关的基因有五组:Group 1、Group 2、Group 3、Group 5、Group 6,说明这155个Ls MYB家族基因直接或间接参与了瓠瓜对白粉病的抗性。本研究为MYB基因在瓠瓜抗病育种及抗病机制的研究、应用提供了理论依据。
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