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水稻InDel和SSR标记多态性的比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 冯芳君 1 ; 罗利军 1 ; 李荧 1 ; 周立国 1 ; 徐小艳 2 ; 吴金红 2 ; 陈宏伟 1 ; 陈亮 2 ; 梅捍卫 2 ;

作者机构: 1.华中农业大学植物科学技术学院

2.上海市农业生物基因中心

关键词: 水稻;SSR标记;InDel标记;多态性

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2005 年 3 卷 05 期

页码: 132-137

收录情况: CSCD

摘要: 为评价插入缺失(InDel)标记在水稻分子育种中的应用价值,本研究用日本晴和9311序列筛选得到遍布每条染色体的20对InDel标记和53对SSR标记,分析46份粳稻和47份籼稻的遗传多样性。研究表明这些InDel标记在籼粳亚种间具有很高的多态性,亚种内多态性较低,平均多态性水平显著小于SSR标记,InDel标记具有数量多,扩增产物稳定和易于检测等优点,将InDel标记应用到遗传图谱构建、基因定位分析和标记辅助选择中可以加速研究进程。

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