文献类型: 中文期刊
作者: 周佳明 1 ; 陈冈 1 ; 司伏生 2 ; 于瑞嵩 2 ; 陈冰清 2 ; 谢春芳 2 ; 李震 2 ; 董世娟 2 ;
作者机构: 1.上海市金山区动物疫病预防控制中心
2.上海市农业科学院畜牧兽医研究所
关键词: 猪戊型肝炎病毒;ORF2基因;分子流行病学;遗传进化分析
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2022 年 38 卷 003 期
页码: 93-97
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解上海郊区猪场戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,从3个猪场随机采集180份新鲜粪便样本,用逆转录巢式聚合酶链反应对HEV ORF2部分基因片段进行扩增、克隆及测序.结果表明:HEV RNA的PCR检测总阳性率为15.6%,个别猪场HEV RNA检出率达30%,且存在基因3型和4型同时检出的情况.经NCBI数据库BLAST比对分析,23份样本为基因4型,5份样本为基因3型.遗传进化分析显示,基因3型和4型毒株与来源于上海地区的参考毒株遗传关系最近,核苷酸同源性分别为97.9%和96.3%.研究表明,上海郊区某些猪场HEV感染率仍较高,且存在基因3型与4型共感染的现象,应注意加强防控.
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