科研产出
鸡胚心脏组织转录组数据鉴定雪域白鸡高原低氧适应性关键基因
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：旨在通过分析白来航（White Leghorn, WL）和雪域白鸡（Xueyu White chicken, XYW）在低氧条件下孵化时胚胎心脏组织的基因表达差异，挖掘鸡胚低氧适应候选基因。本研究在高海拔环境孵化雪域白鸡和白来航鸡种蛋，采集孵化第16天胚胎心脏组织，提取RNA,进行转录组测序（RNA-seq）,筛选差异表达基因（DEGs）,并对其进行荧光定量PCR（qRT-PCR）验证、功能富集分析和构建转录因子-靶基因调控网络，鉴定与雪域白鸡低氧适应相关的候选基因。在雪域白鸡和白来航鸡的心脏组织之间筛选到253个DEGs,随机选择5个DEGs进行qRT-PCR验证，表达趋势与测序结果一致。功能富集分析表明，DEGs主要涉及心血管发育和心脏功能相关的生物学过程和信号通路。将DEGs和已知的鸡转录因子对比，筛选到FOXP2和HOXA2,参与调控血管生成、心肌收缩等，对雪域白鸡胚胎低氧适应起关键作用。本研究通过鸡胚心脏组织转录组数据分析，鉴定到TENM2、NOG、SMOC1、CCBE1等鸡胚高原低氧适应候选基因，为解析雪域白鸡高原低氧适应分子机制提供理论依据。
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自然放牧下霍尔巴绵羊的屠宰性能和肉品质评价
《动物营养学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究自然放牧条件下仲巴县霍尔巴绵羊不同生长阶段的屠宰性能及肉品质，评估霍尔巴绵羊实际养殖生产价值。选用体况、体型基本一致的3月龄霍尔巴绵羊牧群，自然放牧，于育成期（12月龄）和成年期（24月龄）随机选取牧群内试验公羊和母羊各10只，进行体重、体尺指标、屠宰性能、肉品质指标检测。结果表明：1)在育成期，公羊的体重、体高和体长显著高于母羊（P＜0.05）；在成年期，公羊的体重、管围显著高于母羊（P＜0.05）。2)成年羊体重和胴体重显著高于育成羊（P＜0.05），但是屠宰率显著低于育成羊（P＜0.05）。相关性分析发现，宰前活重与胴体重呈极显著正相关（P＜0.01），与屠宰率呈极显著负相关（P＜0.01），胴体重、屠宰率与宰前活重的回归模型中拟合系数（R2）分别为0.456和0.765，回归方程分别为Y=0.127X+11.656和Y=-0.955X+81.786。3)育成羊和成年羊的内脏器官占体重的比率分别为4.85%和3.56%，成年羊的头、蹄、肝脏、脾脏重量显著高于育成羊（P＜0.05）。4)育成羊和成年羊羊肉中水分（73.49%vs. 73.03%）、蛋白质（23.01%vs. 23.35%）、脂肪（3.19%vs. 3.20%）含量均无显著差异（P＞0.05）。5)育成羊羊肉中钙、硒含量显著高于成年羊（P＜0.05），但铜含量显著低于成年羊（P＜0.05），其他矿物元素含量二者间无显著差异（P＞0.05）。6)育成羊和成年羊羊肉中各类氨基酸含量以及必需氨基酸总量无显著差异（P＞0.05），但非必需氨基酸总量表现为育成羊显著低于成年羊（P＜0.05）。育成羊和成年羊羊肉中必需氨基酸含量分别为7.86%和7.95%，必需氨基酸占总氨基酸的百分比（EAA/TAA）分别为41.48%、41.28%，必需氨基酸与非必需氨基酸的百分比（EAA/NEAA）分别为70.87%、70.29%。7)育成羊和成年羊羊肉中各类脂肪酸含量均显示无显著差异（P＞0.05），但成年羊羊肉中未检出二十一碳酸（C21∶0）、顺-13-二十二碳一烯酸（C22∶1n）和顺，顺-11,14-二十碳二烯酸（C20∶2）。由此可见，在环境友好型的自然放牧方式下，霍尔巴绵羊屠宰性能较好，羊肉风味独特、营养价值较高，可提供丰富的蛋白质和钙、磷、铁等矿物元素，富含多种人体必需氨基酸；仅考虑屠宰性能、肉品质表现的前提下，霍尔巴绵羊于育成期12月龄出栏屠宰较为合适。
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拉萨河秋季着生藻类群落结构特征及其水质评价
《环境工程 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解拉萨河秋季着生藻类多样性及水质状况,2017年秋季对拉萨河流域开展了较系统的水环境和着生藻类研究。1)对采集到的样品进行藻类鉴定与分析,现场采用水质测量仪测量水质理化参数。拉萨河秋季共鉴定出着生藻类32种属,以硅藻、绿藻和蓝藻为主,硅藻占总种属的50%。着生藻类平均生物量为0.049 mg/cm~2,生物量偏低,属于贫营养型水体。2)通过Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数和Pielou均匀度指数评价拉萨河秋季水质状况,拉萨河流域直孔电站上游3个采样点的水质优于电站下游4个采样点。3)通过对着生藻类的优势类群与环境因子参数的典范对应分析（CCA）显示,第Ⅰ类群与溶解氧（DO）呈显著负相关性,与电导率（CON）和总氮（TN）呈显著正相关性;第Ⅱ类群与DO呈显著正相关性,与电导率（CON）、pH、水温（WT）、TN和流速（Flo）呈负相关性;其中流速（Flo）与大部分生物类群呈负相关性。期望本研究成果能够为高原河流生态环境保护和管理提供科学依据。
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西藏绒山羊羊绒细度候选基因筛选及其chi-miR-105a靶基因的验证
《中国农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究西藏绒山羊羊绒细度，以及了解相关候选基因对绒山羊产绒性能的影响，本研究对筛选chi-miR-105a靶基因进行验证，以西藏绒山羊为研究对象，联合RNA测序数据和蛋白质组学数据，筛选与羊绒细度相关的关键候选基因，并通过实时荧光定量和双荧光素酶报告基因试验对候选基因进行调控作用验证。结果表明：1)通过转录组和蛋白组数据整理得到384个DE mRNAs, 12个DE miRNAs和29个DEPs。通过多组学联合分析发现CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B基因与羊毛细度相关。2)通过DEG-DE miRNA互作网络图发现chi-miR-105a与靶基因ETV6和PIP5K1B均在网络当中出现。因此对该调控因子进行验证和分析，根据靶基因表达水平试验发现转染chi-miR-105a mimics后引起毛乳头细胞中ETV6基因的mRNA表达显著降低(P<0.001),而PIP5K1B基因的表达量均无显著变化。3)通过双荧光素酶报告基因试验表明，过表达chi-miR-105a后，ETV6酶活性显著降低，即chi-miR-105a可与ETV6的3′UTR区结合。综上，通过多组学联合分析筛选出与羊毛细度相关基因CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B。通过双荧光素酶报告基因进行chi-miR-105a与其预测靶基因ETV6和PIP5K1B的靶标验证，确定chi-miR-105a是ETV6潜在的调控因子，本研究为加快优质绒山羊新品种(系)的培养提供理论依据。
关键词： 西藏绒山羊 多组学联合分析 chi-miR-105a ETV6
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放牧条件下萨福克与河谷型藏绵羊杂交F1代不同部位肌肉营养品质分析
《草业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究萨福克与河谷型藏绵羊杂交F1代肌肉品质营养特性，测定了背最长肌、臂三头肌、股二头肌的肉色、熟肉率、pH、常规营养指标、矿物元素、胆固醇、维生素A、维生素E、维生素B1、维生素B2、氨基酸和脂肪酸含量。结果表明：杂交F1代3个不同部位肉品质有一定差异，主要表现在肉色、粗蛋白质、锌元素、氨基酸、脂肪酸含量方面。其中，背最长肌、臂三头肌的肉色L*值显著高于股二头肌（P＜0.05），背最长肌、股二头肌的肉色a*值显著高于臂三头肌（P＜0.05），背最长肌的肉色b*值显著高于臂三头肌、股二头肌（P＜0.05）；背最长肌的粗蛋白含量显著高于臂三头肌（P＜0.05）；臂三头肌的锌元素含量显著高于背最长肌、股二头肌（P＜0.05）；臂三头肌的谷氨酸含量显著高于背最长肌（P＜0.05），背最长肌的组氨酸含量显著高于股二头肌、臂三头肌（P＜0.05）；背最长肌、股二头肌的棕榈酸含量显著高于臂三头肌（P＜0.05），臂三头肌的花生四烯酸含量显著高于背最长肌（P＜0.05）。综上所述，臂三头肌鲜味类氨基酸含量略高于背最长肌，背最长肌肉品质优于臂三头肌、股二头肌，且3个部分肌肉蛋白营养价值差异不大，均符合人类健康膳食标准。
关键词： 萨福克与河谷型藏绵羊杂交F1代 放牧 不同部位 肉品质 营养组成
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西藏高寒草原5种牧草养分含量及体外消化率季节变化
《中国草地学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为掌握西藏自治区岗巴县高寒草原天然牧草养分含量及消化率季节变化规律,选取垫型蒿、高原鸢尾、藏羊茅、藏西嵩草和线叶嵩草5种牧草,分别分析8月、10月和12月各种牧草的粗蛋白质、脂肪、灰分、钙、磷和中、酸性洗涤纤维含量及干物质和纤维组分体外消化率。结果表明:5种牧草中垫型蒿的粗蛋白质含量最高(17.28%)、线叶嵩草次之(15.73%)、藏羊茅最低(3.15%),脂肪和灰分含量分别为1.31%～1.84%和2.57%～9.90%,钙含量变幅较大(0.27%～4.94%),而磷含量相对稳定(0.09%～0.23%),高原鸢尾的中、酸性洗涤纤维含量最高(84.42%和54.44%),而藏西嵩草和线叶嵩草较低;随季节变迁,粗蛋白质含量逐渐降低而纤维含量(除藏西嵩草)不断升高(P<0.05),脂肪含量无显著变化,灰分含量先升高后降低,钙含量在物种和季节间大幅变动,除线叶嵩草外磷含量逐渐降低。就体外消化率而言,藏西嵩草和线叶嵩草的干物质(71.55%、68.42%)、中性洗涤纤维(53.36%、54.45%)和酸性洗涤纤维(42.10%、45.02%)较高,垫型蒿和藏羊茅次之,高原鸢尾最低(除8月外);除藏西嵩草外,其余4种牧草的干物质和中、酸性洗涤纤维体外消化率均为8月最高,10月次之,12月最低。综合以上,在岗巴县超高海拔高寒草原,藏西嵩草、线叶嵩草的营养价值最好,藏羊茅、垫型蒿次之,高原鸢尾最差。
关键词： 西藏自治区 岗巴县 高海拔地区 牧草营养 动态变化
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基于知识图谱的长江流域内地表蒸散研究进展
《水资源保护 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：以CNKI和Web of Science数据库为数据源，将长江流域范围内地表蒸散研究与国内外地表蒸散研究利用CiteSpace信息可视化软件进行了计量比较分析。结果表明：1992—2020年，国内外共发表地表蒸散为主题的文章5 216篇，其中长江流域范围内179篇，2016年前中英文文章数量皆呈增加趋势；长江流域内地表蒸散研究中，南京信息工程大学、河海大学和中国科学院南京地理与湖泊研究所论文数量在研究机构中名列前三，这些研究机构主要依靠所属试验站提供实测蒸散数据和气象数据进行蒸散模拟与验证研究；研究内容以蒸散获取和数值模拟为重点，其次为地表蒸散变化机制与时空演变过程分析，而关于地表蒸散变化的生态环境效应研究相对较少；从高引用趋势可以发现，在地表蒸散估算精度不断提高的情况下，学者们也逐渐关注蒸散组分、变化机制的研究，环境因子对长江流域内地表蒸散的影响研究较多，而土地利用、地表覆被、植被类型等下垫面性质及变化对蒸散的影响研究较少；蒸散变化效应分析则主要集中在地表蒸散对水平衡、湿地处理以及作物产量的影响。
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成都龙泉山不同林龄香樟人工林土壤养分和微生物群落结构
《应用与环境生物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：香樟(Cinnamomum camphora)是我国南方地区重要的造林树种之一,对于生态恢复和城市绿化具有重要作用.以成都市龙泉山不同林龄香樟人工林(10年、20年和40年)为研究对象,分析土壤主要养分状况和微生物群落的演变特征,并与该区域的天然常绿阔叶林进行比较.结果表明,养分总体状况为20年香樟人工林下较差.随着林龄的增加,香樟人工林下土壤总碳、总氮呈"V"型变化,总磷、总钾、总钙则出现持续消耗的趋势.磷脂脂肪酸法(phospholipid fatty acid,PLFA)结果显示香樟人工林土壤微生物总PLFAs量为37.00-67.80 nmol/g,细菌PLFAs量为25.42-47.60 nmol/g,真菌PLFAs量为7.19-10.00 nmol/g.土壤中微生物细菌、G+细菌、G-细菌、放线菌及总PLFAs均随着林龄呈现先降后升的变化趋势,并主要受土壤铵态氮和硝态氮的调控.相比于快速生长阶段,40年香樟人工林的主要土壤养分和微生物群落各类群PLFAs量与天然常绿阔叶林较为接近,意味着随生长年限增加,香樟人工林能逐步改善土壤肥力.
关键词： 香樟人工林 土壤养分 土壤微生物群落结构 磷脂脂肪酸 龙泉山
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绣球菌双向液体发酵条件优化及其菌丝体多糖抗氧化活性分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]优化马尾松松针-绣球菌双向液体发酵条件,并探究绣球菌菌丝体多糖的抗氧化活性,为绣球菌菌丝体的高效生产提供参考。[方法]采用双向液体发酵法,即在绣球菌发酵培养基中添加适量马尾松松针粉末,通过单因素试验和正交试验探究马尾松松针添加量（0.50,0.75,1.00,1.25,1.50 g/L）、发酵时间（12,16,20,24,28,32 d）、绣球菌接种量（25,50,75,100,125,150 mL/L）、pH（4,5,6,7,8）对绣球菌菌丝体生物量的影响,优化双向液体发酵条件。以未添加马尾松松针粉的处理为对照组,提取菌丝体多糖,采用红外光谱对菌丝体的多糖结构进行分析。测定菌丝体多糖对ABTS自由基和羟基自由基的清除率,分析其抗氧化活性。[结果]单因素试验结果显示,当马尾松松针粉末添加量为1.25 g/L、发酵时间为24 d、接种量为100 mL/L、pH为5时,绣球菌菌丝体生物量均较高。正交试验结果显示,马尾松松针-绣球菌双向液体发酵的最优条件为:马尾松松针粉末添加量1.25 g/L、发酵时间24 d、pH为4、接种量125 mL/L,在此条件下绣球菌菌丝体生物量可达到（11.16±0.22） g/L。与对照组相比,双向液体发酵绣球菌菌丝体生物量提高了约162.10%。红外光谱分析结果表明,马尾松松针-绣球菌双向液体法发酵得到的菌丝体多糖与对照组的红外主要吸收峰一致。抗氧化试验结果显示,绣球菌菌丝体多糖对ABTS自由基、羟基自由基均具有较好的清除能力。[结论]得到了马尾松松针-绣球菌双向液体发酵产绣球菌菌丝体的最佳条件,此条件下得到的菌丝体多糖具有良好的抗氧化活性。
关键词： 绣球菌 马尾松松针 双向液体发酵 菌丝体多糖 抗氧化活性
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基于TMT蛋白组学及生物信息学分析牦牛抗冻差异蛋白
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据.[方法]应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗冻蛋白进行亚细胞定位、结构域、GO功能富集、KEGG信号通路注释、蛋白相互作用等生物信息学分析.[结果]从牦牛耳组织中共鉴定获得21856个肽段(Peptide),其中特有肽段(Unique peptide)序列为18452个,定量获得4519个蛋白,最终筛选出144个差异蛋白,其中上调蛋白89个、下调蛋白55个.144个牦牛抗冻差异蛋白亚细胞定位到7个条目上,分别是细胞核蛋白56个、细胞质蛋白51个、质膜蛋白24个、细胞外蛋白23个、线粒体蛋白18个、细胞骨架蛋白1个和溶酶体蛋白1个;共鉴定到194个结构域.GO功能富集分析结果显示,生物过程主要富集到细胞过程蛋白79个、代谢过程蛋白70个和生物调控蛋白42个等,分子功能主要富集到结合功能蛋白75个和催化活性蛋白64个等,细胞组分主要富集到细胞部分蛋白89个和细胞蛋白89个等.144个牦牛抗冻差异蛋白在KEGG数据库中注释到205条KEGG信号通路,主要涉及核糖体、氮代谢、胞质DNA感受、动物体内生热作用、氧化磷酸化、白细胞介素-17及钙离子信号等通路.牦牛抗冻差异蛋白相互作用网络分析发现L8IHE5的关联度最高,且冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)和HSP70结合蛋白在蛋白相互作用网络中具有更多的相互作用关系.[结论]基于TMT蛋白组学对牦牛抗冻差异蛋白进行挖掘,结果鉴定获得144个抗冻差异蛋白(上调蛋白89个,下调蛋白55个),其中CIRP和HSP70在冷应激条件下呈上调趋势,能促使牦牛肌体适应低温环境,可作为牦牛抗冻性育种的候选分子标记.
关键词： 牦牛;TMT蛋白组学;生物信息学;抗冻性;差异蛋白
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