文献类型： 中文期刊

作者： 胡紫平 ¹ ; 王立刚 ¹ ; 宗文成 ¹ ; 侯任达 ¹ ; 苏艳芳 ¹ ; 牛乃琪 ¹ ; 王立贤 ¹ ; 王源 ² ; 张龙超 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

2.青岛农业大学动物科技学院

关键词： 剑白香猪;群体结构;ROH;SNP;遗传多样性

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 4117-4125

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在从分子水平分析剑白香猪的群体结构以及遗传多样性，对剑白香猪的种质资源鉴定和保护提供技术支持。本研究利用Porcine SNP50 BeadChip （Illumina, United States）芯片对138头剑白香猪的全基因组SNP进行扫描，通过对主成分、遗传距离、亲缘关系和公猪血统进行分析，研究剑白香猪的群体结构；通过ROH分析，确定剑白香猪的遗传多样性。结果显示，此剑白香猪群体无明显分层，但大致可以分为3个部分，群体内的遗传距离平均值约为0.273,所有公猪划分为4个血统；剑白香猪群体共检测出2 893个ROHs,平均每个个体约有21个ROHs,平均ROH长度约为7.18 Mb,平均近交系数(F_ROH)为0.27%,表明剑白香猪近交积累较少。通过多种分析表明，该群体家系数量适中，个别家系公畜数量较少，个体间亲缘关系中等，近交程度较低，群体的遗传多样性较高。本研究在基因组水平分析了剑白香猪的群体遗传结构和遗传多样性，为剑白香猪群体复壮和种业安全措施制定提供了分子依据。