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不同国家和地区海岛棉SSR遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邓艳凤 1 ; 路普 1 ; 周忠丽 1 ; 蔡小彦 1 ; 王星星 1 ; 王玉红 1 ; 张振梅 1 ; 刘方 1 ; 王坤波 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室

关键词: 海岛棉;SSR标记;遗传多样性;聚类分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 302-316

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究利用60对SSR引物对9个国家的299份海岛棉材料进行遗传多样性分析。试验显示,60对SSR引物在299份海岛棉材料中共检测出209个等位基因,其中多态性等位基因185个,占88.5%;Ne值在1.020~3.940之间,平均为2.220;H′值在0.056~1.385之间,平均为1.109;PIC变幅为0.020~0.746,平均0.505。利用NYSTS-pc2.20软件,采用类平均法(UPGMA)进行聚类分析,299份海岛棉种质间SSR相似系数变幅为0.206~1,平均相似系数0.756。在阈值0.69处294份海岛棉分为两类,第I类进一步可分为6个亚类,其余5份材料与其它种质遗传距离较远被单独归为一类。试验所得表明:不同海岛棉种质,大多根据来源地和品系聚为一类,且相似系数的变化幅度较大;阿根廷地区海岛棉遗传多样性最为丰富,而来自其它地区的海岛棉材料遗传距离较为狭窄。这些成果为研究海岛棉在全球的传播驯化及中国海岛棉的育种工作提供参考。

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