文献类型： 中文期刊

作者： 张雪莲 ¹ ; 晋大鹏 ² ; 刘敏 ¹ ; 吴怡琦 ¹ ; 李文霞 ¹ ; 秦本源 ¹ ; 蔡春波 ¹ ; 高鹏飞 ¹ ; 郭晓红 ¹ ; 李步高 ¹ ; 曹果清 ¹ ;

作者机构： 1.山西农业大学动物科技学院

2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词： 马身猪;CD63基因;克隆;表达特征;生物信息学

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 008 期

页码： 22-29

收录情况： 北大核心

摘要： 为了克隆马身猪CD63基因的CDS区,检测其在不同组织中的表达规律,预测编码蛋白的结构与功能,该研究对山西省地方品种马身猪CD63基因CDS区进行扩增和克隆,采用qRT-PCR技术检测CD63基因在心脏、肝脏、脾脏、肾脏、腰大肌、背部皮下脂肪等组织中的表达规律,采用生物信息学方法分析CD63蛋白的生物学特性。结果表明,该研究成功克隆出猪CD63基因的CDS区,全长714 bp,已上传NCBI数据库,登录号为MN082631。该基因在所检测的组织中均有表达,且在不同组织中的表达量有显著差异（P<0.05）,脂肪组织中表达量最高,其次是肝脏、肌肉、脾脏,肾脏中的表达量最低。经生物信息学预测,该基因编码的蛋白质含237个氨基酸,属于中性稳定四跨膜蛋白,有3个可能的N-糖基化位点,其中2个位点位于第3个与第4个跨膜结构域之间的胞外区内,另一个在第1个与第2个跨膜结构域之间的胞外区内;可能存在Ser磷酸化位点6个,Thr磷酸化位点4个,Tyr磷酸化位点1个;CD63蛋白为疏水性蛋白,α-螺旋、延伸、β-折叠和无规则卷曲分别占58.23%、11.39%、5.49%和24.89%。猪CD63蛋白氨基酸序列与野骆驼的相似性最高,其次是羊驼、长江江豚和抹香鲸,同时与骆驼科的野骆驼和羊驼的遗传距离最近,符合生物进化规律。该试验成功克隆了马身猪CD63基因CDS区,并进行了生物信息学分析,为深入探讨CD63基因生物学功能提供参考。