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大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 宋晴晴 1 ; 张慧敏 1 ; 张烨 1 ; 张一卉 1 ; 李景娟 1 ; 李化银 1 ; 贺立龙 1 ; 王凤德 1 ; 高建伟 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心;山东师范大学生命科学学院;黄山学院生命与环境科学学院

关键词： 大白菜;GID1基因;生物信息学分析;表达模式分析

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2020 年 03 期

页码： 1-7

摘要： GID1蛋白是赤霉素信号转导过程中的重要受体,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用。本研究采用生物信息学分析方法对大白菜基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、染色体分布、系统进化以及表达模式等进行分析。结果表明,大白菜基因组中含有5个GID1家族成员,分别位于4、5、6、7、9号染色体上,各成员都只含有1个内含子。系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白明显处于两个不同分支,大白菜GID1家族成员与拟南芥GID1具有更近的亲缘关系。通过表达模式以及启动子顺式响应元件分析发现,大白菜GID1基因不仅参与生长发育调控还可能参与对不同环境因子的响应过程。

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