文献类型: 中文期刊
作者: 吕宝莲 1 ; 杨宇昕 2 ; 崔立操 2 ; 史峰 3 ; 马亮 3 ; 孔秀英 2 ; 张立超 2 ; 倪志勇 1 ;
作者机构: 1.新疆农业大学生命科学学院
2.中国农业科学院作物科学研究所
3.石家庄市农林科学研究院
关键词: 小麦;bHLH转录因子;盐胁迫;生物信息学分析
期刊名称: 作物杂志
ISSN:
年卷期: 2024 年 001 期
页码: 65-72
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 碱性螺旋―环―螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子作为植物中第二大类转录因子家族,在植物生长发育、信号传导、生物合成以及响应非生物胁迫等方面发挥重要功能。为了探讨小麦bHLH转录因子在盐胁迫应答中的功能,以冬性小麦科农199为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析的方法对小麦bHLH转录因子在盐胁迫下的表达特性进行系统分析。结果表明,小麦中共有489个bHLH转录因子,分布在21条染色体上;构建系统进化树将bHLH家族进一步划分为9个亚族,其中VI亚族成员最多,IV亚族成员最少;盐胁迫下小麦根转录组测序结果表明,在盐胁迫处理后1和6h差异表达基因(DEG)共有44个,其中上调表达的基因有17个,下调表达的有27个;GO分析表明,DEG富集在水、盐胁迫、生长素调节等方面;KEGG注释分析表明,DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢途径以及氨基糖和核苷酸糖代谢等信号通路;对部分DEG进行qRT-PCR验证,结果表明DEG的表达模式与转录组测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。
- 相关文献
[1]小麦盐胁迫相关基因TabHLH13的克隆与分析. 符思路,刘国祥,张立超,夏川,赵光耀,贾继增,孔秀英. 2014
[2]小麦非生物胁迫响应基因TabHLH39/44和TabZIP15的功能分析. 翟亦倩. 2016
[3]小麦bHLH转录因子的鉴定和表达分析. 符思路. 2014
[4]Wheat; Lumai 14; Germplasm resource; Strategy for improvement. 韩微波,刘录祥,郭会君,赵林姝,王成社. 2005
[5]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016
[6]小麦TaMICU1-6A基因的克隆、生物信息学及表达分析. 李欣,李鲁华,任明见,安畅,洪鼎立,赵鹏鹏,徐如宏. 2024
[7]小麦VQ家族全基因组鉴定与表达分析. 李虎滢,魏春茹,孟钰玉,范润侨,于秀梅,刘大群. 2020
[8]小麦TaSRG1基因的克隆、生物信息学分析及表达特征. 徐灵,洪鼎立,邓云颢,徐如宏,李鲁华. 2024
[9]水杨酸和阿斯匹林对小麦盐害的缓解作用. 张士功,高吉寅,宋景芝. 1999
[10]基于物种敏感性分布(SSD)的耐盐与Pb低吸收小麦筛选研究及应用. 孟楠,王萌,雷小琴,陈莉,郑涵,陈世宝. 2019
[11]小麦bZIP家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析. 毕晨曦,杨宇昕,于月华,李丹萍,史峰,马亮,孔秀英,张立超,倪志勇. 2021
[12]小麦盐胁迫响应的代谢组学分析. 姜雪敏,陈向前,李红燕,姜奇彦. 2023
[13]森林草莓FvbHLH130转录因子调控植株提前开花. 宋艳红,陈亚铎,张晓玉,宋盼,刘丽锋,李刚,赵霞,周厚成. 2023
[14]日本百脉根LjbHLH34基因克隆及耐旱功能鉴定. 刘福,陈诚,张凯旋,周美亮,张新全. 2023
[15]小麦盐胁迫应答相关基因TaERF5的功能研究. 张蕾. 2013
[16]小麦耐盐相关基因片段的筛选与克隆. 王涛. 2002
[17]小反刍兽疫病毒等三种麻疹病毒属病毒N基因的生物信息学分析与比较. 马震原,李刚. 2011
[18]梅花鹿FGF10基因的生物信息学分析. Ju Yan,鞠妍,Liu Huamiao,刘华淼,Wei Haijun. 2016
[19]鹿茸发育相关基因筛选和生物信息学分析. 鲍加荣. 2008
[20]日本血吸虫体被表膜蛋白分析及表膜蛋白SjNPP-5的初步研究. 张旻. 2011
作者其他论文 更多>>
-
北方粳稻密苗机插育秧对秧苗素质及取秧特性的影响
作者:董立强;张义凯;杨铁鑫;冯莹莹;马亮;梁潇;张玉屏;李跃东
关键词:水稻;密播乳苗;取秧特性;机插
-
TaEMF2调控小麦抽穗期的功能分析
作者:武丽芬;夏川;张立超;孔秀英;陈景堂;刘旭
关键词:小麦;抽穗期;TaEMF2;CRISPR/Cas9基因编辑;过表达
-
小麦籽粒性状的遗传效应分析及其育种策略
作者:袁谦;赵永涛;张中州;甄士聪;望俊森;张立超;张文斐
关键词:小麦籽粒性状;SmartGrain软件;图像分析;主基因+多基因
-
基于两个陆地棉低世代群体定位纤维品质相关QTL
作者:郭晓豪;郭晓豪;王寒涛;魏鑫;张晶晶;付小康;马亮;魏恒玲;喻树迅
关键词:陆地棉;纤维品质;SSR;连锁图谱;QTL
-
小麦bZIP家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析
作者:毕晨曦;杨宇昕;于月华;李丹萍;史峰;马亮;孔秀英;张立超;倪志勇
关键词:小麦;bZIP转录因子;转录组测序;盐胁迫
-
黄淮南片小麦主要品质性状相关性分析
作者:望俊森;张中州;袁谦;甄士聪;史峰;王丽娜;张朋伟;徐立平;张立超;赵永涛
关键词:普通小麦;品质性状;相关性分析;黄淮南片
-
新疆无花果花叶病病毒鉴定与发生调查
作者:吐逊艾力·艾孜提力;侯婉莹;代毅;倪志勇;麦合木提江·米吉提
关键词:无花果花叶病;高通量测序;RT-PCR;PCR;病毒种类;新疆




