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基于SLAF-seq技术的苹果SNP位点开发及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘万达 1 ; 杨光 1 ; 焦奎宝 1 ; 王昆 1 ; 王天鹤 1 ; 王禹 1 ; 吴立仁 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院果树研究所/农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室;黑龙江省农业科学院园艺分院;黑龙江省农业科学院乡村振兴科技研究所

关键词： 苹果;SLAF-seq技术;SNP;遗传多样性分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 51 卷 008 期

页码： 61-66

收录情况： 北大核心

摘要： 为了解黑龙江苹果种质资源的遗传关系,利用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对在黑龙江地区收集的31份苹果种质资源进行SNP位点开发和遗传多样性分析.最终获得了 107.52 Mb读长数据,不同材料的SNP标记数目在309 012~540 030间,样品测序质量值平均Q30为93.78%,平均GC含量为40.90%.共开发获得1 072 115个SLAF标签,其中,多态性SLAF标签有275 389个.通过序列分析,共得群体SNP位点121 352个,基于开发SNP分子标记,结果表明,31份苹果种质资源分为3个亚群,特异性的苹果SNP位点开发和研究可为苹果种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础.

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