文献类型： 中文期刊

作者： 冀晓昊 ¹ ; 郑道君 ² ; 谢圣华 ² ; 时梦 ³ ; 钟义旺 ² ; 王莹莹 ³ ; 王孝娣 ³ ; 刘凤之 ³ ; 冯学杰 ² ; 王海波 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院国家南繁研究院

2.海南省农业科学院三亚研究所/海南省农业科学院热带果树研究所/农业农村部热带果蔬遗传资源评价与利用重点实验室(省部共建)/海南省热带果树生物学重点实验室/农业农村部海口热带果树科学观测实验站/海南省热带果树野外科学观测研究站

3.中国农业科学院果树研究所/农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室

关键词： 榴莲;变异位点;SNP;群体进化

期刊名称： 农业大数据学报

ISSN： 2096-6369

年卷期： 2025 年 7 卷 002 期

页码： 227-237

摘要： 榴莲具有较高的经济价值和营养价值。我国榴莲高度依赖进口，海南省榴莲产业处于刚刚起步阶段，存在面积少、产量低、品种完全依赖引种而缺乏自主性、配套栽培技术欠缺等诸多问题，导致市场需求大而产业薄弱的矛盾突出，迫切需要进行榴莲种质资源收集、鉴定与评价。该研究对99份榴莲种质资源提取DNA，构建文库并开展了二代全基因组测序，对测序数据开展了质控、变异位点挖掘注释和群体进化等生信分析。测序数据量共计1.62 Tb，共挖掘到54 974 697个变异位点，包括SNP、INS和DEL三种变异类型，以SNP为主，榴莲基因组中平均每13个碱基有1个变异位点，变异位点主要位于基因间，位于基因外显子和内含子的较少。99份榴莲资源可以分成3个亚群，LD系数降低到最大值的一半的衰减距离只有0.1-0.2 kb，表现出丰富的遗传多样性。99份榴莲种质资源的基因组测序数据和变异位点信息，为榴莲遗传学以及育种方法和育种理论研究提供了基础数据支撑，有助于海南乃至世界榴莲品种选育。