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烟草抗赤星病主效QTL的候选基因初步筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 张雨生 1 ; 蒋彩虹 1 ; 胡晓莉 1 ; 赵强 1 ; 耿锐梅 1 ; 杨爱国 1 ; 程立锐 1 ; 王元英 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院烟草研究所烟草行业烟草基因资源利用重点实验室

关键词: 烟草;赤星病;QTL;SNP;基因筛选

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 13 期

页码: 4325-4332

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为克隆烟草赤星病主效抗性QTL,在本实验室对抗性基因初步定位的基础上,以净叶黄与NC82组合产生的回交导入系群体BC3F2为材料,在目标区间内加密26个SNP分子标记,利用Mass ARRAY飞行质谱技术检测基因型,进一步缩小目标区间。进而利用生物信息学、RT-PCR等方法在DNA水平和RNA水平对候选基因进行了初步筛选。分析表明,主效抗病QTL所在区间被进一步定位在1.6 c M范围内,对抗感品种主效区间内基因进行DNA序列及生物信息学分析,最终将53M-1和54M-3基因确定为候选基因。两个候选基因在抗感品种中表达差异明显,分别为O-甲基转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶类基因,与植物抗逆性相关,与烟草抗病性过程关系紧密。相关结果为进一步挖掘抗赤星病主效基因提供帮助,同时也对烟草赤星病抗性分子辅助改良具有重要意义。

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