文献类型: 中文期刊
作者: 曹志洋 1 ; 高丽锋 2 ; 姜东言 1 ; 王曙光 1 ; 杨进文 1 ; 贾继增 2 ; 李宁 1 ; 孙黛珍 1 ;
作者机构: 1.山西农业大学农学院
2.中国农业科学院作物科学研究所
关键词: 小麦;低磷胁迫;全基因组关联分析;SNP;候选基因
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2025 年 51 卷 010 期
页码: 2632-2651
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 磷是作物生长发育所必需的大量元素之一,土壤中只有少部分磷可被植物有效利用,而长期施用磷肥又可能造成环境污染。因此筛选强耐低磷品种、挖掘耐低磷相关QTL与候选基因具有重要意义。本研究采用389份小麦品种组成的自然群体,在正常磷(对照)和低磷条件下进行3年(2022—2024)的苗期水培试验,测定苗高、主根长、根条数、茎叶干重、根干重、总根长、根面积、根直径和根尖数9个性状,并计算每个性状的耐低磷系数和BLUP值,然后根据耐低磷系数计算综合评价D值。基于3个环境下的BLUP值进行相关性分析,发现低磷和对照条件下,除根直径外,大多数性状之间呈显著正相关。利用综合评价D值进行聚类分析显示,“丰德存麦1号”在4个环境(2022、2023、2024、BLUP)下均被鉴定为强耐低磷型品种。结合660K SNP芯片,对4个环境下9个性状的耐低磷系数和D值进行全基因组关联分析,共检测到1197个显著关联的SNP标记,形成了464个QTL。其中在2个环境下重复检测到20个QTL,在3个和4个环境下重复检测到7个QTL,标记位点解释的贡献率R2范围为4.09%~10.58%。然后,利用前人报道的转录组数据结合基因功能注释,在这7个QTL区间内筛选到3个耐低磷相关候选基因,其中TraesCS4D02G022900和TraesCS4D02G023300编码F-box家族蛋白,拟南芥的同源基因At5g21040编码一种同时含有WD40和F-box结构域的蛋白,是磷饥饿响应的负调控因子; TraesCS6D02G154700编码的类受体蛋白激酶与植物的生长、发育、抗逆以及抗病有关。进一步分析这3个候选基因低磷胁迫下叶片和根系的表达模式,发现均具有差异表达,与前人的转录组结果一致。这些发现为选育耐低磷小麦品种,解析低磷胁迫相关基因的功能和调控机制提供了基础。
- 相关文献
[1]低磷胁迫下大豆苗期根系性状全基因组关联分析. 孙畅,刘美玲,刘子君,杨光,梁腾月,周宣汝,赵悦如,张洛桐,谷勇哲,敖雪. 2024
[2]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 2015
[3]小麦幼苗根系性状全基因组关联分析及TaSRL-3B优异等位基因发掘. 蔡金珊,李超男,王景一,李宁,柳玉平,景蕊莲,李龙,孙黛珍. 2025
[4]耐低氮小麦品种的筛选及耐低氮指数的全基因组关联分析. 李宁,高丽锋,黄鑫,史华伟,杨进文,史雨刚,陈明,贾继增,孙黛珍. 2025
[5]全基因组关联分析定位与挖掘小麦氮高效基因. 赵超男,王金凤,张玉,张丽,李瑞琦,王鹏飞,李鸽子,张宏军,虞波,康国章. 2025
[6]陆地棉自然群体纤维强度性状的全基因组关联分析. 贾冰,贾冰,马建江,宋吉坤,裴文锋,吴嫚,臧新山,张金发,陈全家,于霁雯. 2021
[7]基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制. 唐鑫鑫,郑炬梅,骆娜,营凡,朱丹,李森,刘大伟,安炳星,文杰,赵桂苹,李和刚. 2024
[8]玉米穗行数全基因组关联分析. 张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海. 2014
[9]棉籽大小数量性状核苷酸定位及候选基因初步筛选. 乔丹,白冰楠,葛群,刘小芳,栾玉娟,牛皓,龚举武,巩万奎,闫浩亮,李俊文,刘爱英,石玉真,Elsamman Elameer,陈全家,袁有禄. 2024
[10]玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析. 陈芳,张进艳,李亮,马艺文,王振萍,段运平,郝转芳. 2014
[11]白菜类作物开花时间的全基因组关联分析. 高宝祯,刘博,李石开,梁建丽,程锋,王晓武,武剑. 2017
[12]黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析. 贾会霞,李锡香,宋江萍,林毓娥,张晓辉,邱杨,阳文龙,娄群峰,王海平. 2021
[13]玉米花期根系结构的表型变异与全基因组关联分析. 张小琼,郭剑,代书桃,任元,李凤艳,刘京宝,李永祥,张登峰,石云素,宋燕春,黎裕,王天宇,邹华文,李春辉. 2019
[14]不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析. 宋晓宇,毛婷婷,王立伟,刘丽凤,李晓那,孙石,韩天富. 2018
[15]黄瓜幼苗下胚轴长度GWAS分析及候选基因挖掘. 蔡和序,薄凯亮,周琪,苗晗,董邵云,顾兴芳,张圣平. 2020
[16]陆地棉棉籽相关性状的QTN挖掘及候选基因筛选. 白冰楠,乔丹,葛群,栾玉娟,刘小芳,卢全伟,牛皓,龚举武,巩万奎,ELAMEERELSAMMAN,闫浩亮,李俊文,刘爱英,石玉真,王海泽,袁有禄. 2024
[17]花生超长链脂肪酸含量的关联作图及候选基因表达分析. 郭泽佳,林伟津,李少雄,刘浩,李海芬,王润风,黄璐,余倩霞,洪彦彬,陈小平,冯发强,鲁清. 2025
[18]全基因组关联分析结合单倍型分析挖掘水稻耐低氮候选基因. 邵美红,赵玲玲,程楚,程思明,朱双兵,翟来圆,陈凯,徐建龙. 2025
[19]烟草青枯病抗性的全基因组关联分析. 何斌彬,耿锐梅,杨爱国,任民. 2020
[20]甘蓝型油菜RIL群体株高性状的全基因组关联分析. 黄静,程明星,唐敏强,张凤启,张园园,童超波,刘越英,程晓晖,董彩华. 2016
作者其他论文 更多>>
-
新疆塔里木双峰驼遗传资源的保护与利用
作者:于沁冉;王佟;李宁;邓婧瑛;贾建磊;阎萍
关键词:塔里木双峰驼;种质特性;保护;利用
-
帕米尔牦牛MYL2基因克隆及其在不同组织中的表达分析
作者:于沁冉;王佟;邓婧瑛;包鹏甲;李宁;阎萍;贾建磊
关键词:帕米尔牦牛;MYL2基因;基因克隆;生物信息学
-
小麦幼苗根系性状全基因组关联分析及TaSRL-3B优异等位基因发掘
作者:蔡金珊;李超男;王景一;李宁;柳玉平;景蕊莲;李龙;孙黛珍
关键词:小麦;幼苗;根系形态;全基因组关联分析;候选基因
-
耐低氮小麦品种的筛选及耐低氮指数的全基因组关联分析
作者:李宁;高丽锋;黄鑫;史华伟;杨进文;史雨刚;陈明;贾继增;孙黛珍
关键词:小麦;耐低氮性;耐低氮指数;全基因组关联分析;候选基因
-
"新会计法"下加强单位内部会计监督的思考
作者:任红艳;李宁
关键词:新会计法;会计监督;高质量发展
-
生乳中风味物质特征及来源研究进展
作者:陈银阁;张养东;李宁;张元庆
关键词:生乳;风味;挥发性化合物
-
小麦TabHLH112-2B基因克隆及每穗小穗数相关功能标记开发
作者:范子培;李龙;史雨刚;孙黛珍;李超男;景蕊莲
关键词:小麦;TabHLH112-2B;分子标记;关联分析;每穗小穗数;优异单倍型




