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基于SCoT标记分析紫花苜蓿遗传多样性的取样数量(英文)

文献类型: 中文期刊

作者: 毛培 1 ; 申书恒 1 ; 蒲军 1 ; 娄可可 1 ; 周强 1 ; 王增裕 1 ; 孙娟 1 ; 刘志鹏 1 ;

作者机构: 1.兰州大学草地农业科技学院兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室;青岛农业大学草业学院草地农牧业研究中心

关键词: 紫花苜蓿;SCoT标记;遗传多样性;取样数量

期刊名称: 草地学报

ISSN: 1007-0435

年卷期: 2022 年 05 期

页码: 1110-1121

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究采用目标起始密码子多态性(Start codon targeted, SCoT)标记,对600份不同紫花苜蓿(Medicago sativa L.)材料(共6个种质)的基因组DNA进行扩增,分析了不同取样数量下(10,15,20,30,40,50,60,70,80,90和100)紫花苜蓿的遗传多样性,旨在筛选出代表紫花苜蓿种群遗传多样性的最佳取样单株数。结果发现,6条SCoT引物共扩增出80个条带,平均每条引物的扩增条带数为13.3个,多态性条带百分率为100%。在评价不同取样梯度下的紫花苜蓿遗传多样性覆盖度时发现,当取样数量增加至40时,6个供试紫花苜蓿种质的遗传多样性覆盖率均达到95%以上。此外,本试验采用UPGMA与STRUCTURE聚类分析方法,分析了不同取样梯度下紫花苜蓿的遗传结构。结果表明,样本量为40时能够有效反映紫花苜蓿群体间差异。

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