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基于转录组百合WRKY转录因子的挖掘与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周俐宏 1 ; 石慧 2 ; 李雪艳 1 ; 王伟东 1 ; 白一光 1 ; 胡新颖 1 ; 杨迎东 1 ;

作者机构: 1.辽宁省农业科学院

2.沈阳农业大学植物保护学院

关键词: 百合;WRKY;序列分析;系统进化

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 007 期

页码: 2144-2151

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: WRKY是一类与植物生物胁迫反应相关的转录因子,是植物中特有的超基因家族。为了挖掘百合抗蚜虫胁迫相关的WRKY基因,本研究利用棉蚜胁迫的百合转录组数据,对WRKY进行筛选及保守结构域分析,对鉴定出的WRKY转录因子进行生物信息学分析。结果表明:百合中筛选的29个WRKY基因的蛋白为99~675个氨基酸,理论等电点的范围为5.06~11.19。在LhWRKY基因编码的所有蛋白中,其中LhWRKY5和LhWRKY26为稳定蛋白,其余LhWRKY属于不稳定蛋白。所有LhWRKY蛋白均定位于细胞核,属于亲水性蛋白。除LhWRKY2、LhWRKY3、LhWRKY5、LhWRKY20四个蛋白外,均具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。LhWRKY包含三类WRKY转录因子,部分蛋白发生变异。系统进化树发现,有3个WRKY基因与已知抗生物胁迫基因同源性较高,推测其参与百合抗蚜胁迫反应。研究结果可以通过筛选的WRKY基因,进行进一步的功能验证,为植物抗生物胁迫尤其是抗蚜育种提供分子基础。

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