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白灵侧耳ACC基因克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 田雨 1 ; 郝刘斌 1 ; 李海康 1 ; 冯璠 1 ; 王春霞 1 ; 张瑞颖 2 ; 郑素月 1 ;

作者机构: 1.河北工程大学园林与生态工程学院

2.中国农业科学院农业资源与农业区划研究所

关键词: 白灵侧耳;乙酰辅酶A羧化酶;基因克隆;系统发育;表达

期刊名称: 食用菌学报

ISSN: 1005-9873

年卷期: 2024 年 31 卷 005 期

页码: 9-16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过克隆白灵侧耳(Pleurotus tuoliensis)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylase, ACC)基因,采用生物信息学方法预测白灵侧耳ACC的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构和保守结构域;基于白灵侧耳ACC与灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)、糙皮侧耳(P. ostreatus)、香菇(Lentinula edodes)、刺芹侧耳(P. eryngii)等16个物种的氨基酸序列,采用邻接法构建系统发育树;通过荧光定量PCR测定pH为3、4、5、6、7、8、9、10、11、12时的白灵侧耳ACC的相对表达量。结果表明:白灵侧耳ACC DNA长度为7 366 bp,包含12个内含子和13个外显子,cDNA长度为6 696 bp,共编码2 231个氨基酸残基,相对分子质量为247 400,白灵侧耳ACC为酸性、不稳定的亲水蛋白质,不具有信号肽和跨膜结构域,可能存在于细胞质、细胞核或过氧化物酶体中,主要由α螺旋、无规卷曲、β折叠和β转角组成,含有ACC中心区、生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白质和羧基转移酶4个保守结构域;系统发育树表明,白灵侧耳ACC的氨基酸序列与担子菌中的刺芹侧耳相似度较高;与对照组(pH5.42)相比,pH为6、7、8、9、10、11时,ACC相对表达量显著增加(P<0.05)。

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