文献类型： 中文期刊

作者： 张红 ¹ ; 张悦新 ² ; 徐楠 ² ; 芮存 ² ; 范亚朋 ² ; 王晶 ² ; 韩明格 ² ; 王琴琴 ² ; 孙亮庆 ² ; 陈修贵 ² ; 陆许可 ² ; 王俊娟 ² ; 王德龙 ² ; 王帅 ² ; 郭丽雪 ² ; 赵兰杰 ² ; 陈超 ² ; 陈全家 ¹ ; 叶武威 ¹ ;

作者机构： 1.新疆农业大学农学院

2.中国农业科学院棉花研究所

关键词： 海岛棉;磷脂酶A1;基因克隆;表达分析;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1421-1429

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解海岛棉GbPLA1-32基因结构特征及功能，本研究以海岛棉‘海7124’为实验材料，利用前期耐盐转录组测序结果筛选得到差异表达基因并进行克隆。通过生物信息学分析，获得‘海7124’GbPLA1-32基因全长CDS，分析该基因编码蛋白的理化性质、鉴定其亲水性与疏水性，对磷酸化和糖基化位点、信号肽和跨膜区以及蛋白质结构进行预测，确定亚细胞定位并构建系统进化树。结果表明，该基因编码区全长1 530 bp，编码509个氨基酸，编码蛋白在磷脂酶A1家族，属α/β-水解酶超家族。它属于亲水性蛋白，不存在明显信号肽且不具有跨膜结构，亚细胞定位于叶绿体中。同时，α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲这4个元件构成了Gb PLA1-32蛋白的二级结构。进化树分析表明海岛棉与陆地棉亲缘关系最为接近，根据其编码蛋白将该基因命名为GbPLA1-32。RT-qPCR分析结果表明，GbPLA1-32基因能够对PEG和盐两种胁迫做出响应。本研究结果可为进一步阐明GbPLA1-32在海岛棉中的生物学功能提供参考。