文献类型: 中文期刊
作者: 高俊 1 ; 周琳 2 ; 聂志娟 1 ; 王耀辉 3 ; 徐钢春 1 ;
作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
2.上海海洋大学水产与生命学院
3.南通龙洋水产有限公司
关键词: 刀鲚;Edn1基因;性状关联分析;双倍型分析;连锁不平衡
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2023 年 003 期
页码: 259-267
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探究刀鲚(Coilia nasus)内皮素1 (endothelin 1, Edn1)基因对刀鲚上颌骨长度的影响,根据此前的基因组重测序结果以及刀鲚基因组数据库,通过PCR扩增得到刀鲚Edn1基因序列,并使用直接测序法筛选并分析单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,分析各位点的基因型,并计算各位点的基本遗传参数、基因型频率和基因频率,将筛选出的SNP位点与刀鲚上颌骨长度性状进行关联分析、连锁不平衡分析和双倍型分析。结果表明,在刀鲚Edn1基因中共挖掘出5个SNP位点,分别为T134C、A418C、G1322A、C1607T、A1636C。G1322A与A1636C两个位点之间处于连锁不平衡状态。关联分析结果显示, T134C位点和A418C位点与上颌骨长度性状之间存在显著相关性;双倍型分析结果显示,T134C位点和A418C位点组成的双倍型中,D3(杂合TC和纯合AA)的上颌骨长度显著长于D1(纯合TT和杂合AC)和D2(纯合TT和纯合CC)。此外,刀鲚开口高度/头长和上颌骨长/头长的皮尔逊相关系数r=0.41,属中等正相关。研究结果表明, T134C位点和A418C位点是刀鲚上颌骨长度的优势位点,双倍型D3为优势基因型。本研究可为刀鲚长颌骨分子标记辅助选育的候选标记提供科学依据。
- 相关文献
[1]基于AFLP标记技术的刀鲚群体遗传学研究. 宋娜,韩刚,高天翔. 2012
[2]鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析. 闵霞,贾智英,李池陶,李飞,石连玉. 2012
[3]尼罗罗非鱼β_2m基因SNP位点和单倍型与无乳链球菌抗性的关联分析. 张栋,高风英,卢迈新,曹建萌,刘志刚,可小丽,王淼. 2018
[4]半滑舌鳎有效群体大小估计. 王伟峰,崔瑜,蒋丽,王悦玲,王焕岭,李恒德. 2019
[5]利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构. 张媛,胡则辉,周志刚,陈亚瞿. 2006
[6]急性操作胁迫对刀鲚应激反应相关神经内分泌因子的影响. 王宇,卢丹琪,李伟萍,徐跑,顾若波,姚谧,梁瑶思,张勇,林浩然. 2014
[7]池养刀鲚(Coilia nasus)鱼种的摄食与生长. 徐钢春,徐跑,顾若波,张呈祥,郑金良. 2011
[8]刀鲚水通道蛋白1的分子克隆及高盐作用下的表达分析. 王美垚,杨健,徐跑,徐钢春,徐东坡,尤洋,刘凯,段金荣,周彦锋,方弟安,张敏莹,俞振飞. 2017
[9]刀鲚Δ6脂肪酸去饱和酶cDNA的克隆与组织表达检测. 魏广莲,徐钢春,顾若波,杜富宽,徐跑. 2014
[10]长江安庆江段刀鲚耳石微化学及洄游生态学意义. 李孟孟,姜涛,陈婷婷,刘洪波,杨健. 2017
[11]刀鲚精巢发育的组织学研究. 徐钢春,聂志娟,张呈祥,魏广莲,徐跑,顾若波. 2012
[12]基于mtDNA Cytb序列分析养殖与野生刀鲚群体的遗传多样性. 魏广莲,徐钢春,顾若波,李建林,徐跑. 2012
[13]长江江苏江段刀鲚的研究进展(英文). 段金荣,张红燕,刘凯,徐东坡,张敏莹,施炜纲. 2012
[14]刀鲚POMC基因的cDNA克隆及其应激应答. 杜富宽,徐钢春,黎燕,练青平,徐跑. 2017
[15]养殖刀鲚与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析. 聂志娟,徐钢春,程起群,张勇,杜富宽,顾若波. 2014
[16]双台子河口刀鲚个体生殖力. 霍堂斌,郑文军,李耕,赵荣伟,代尚英,那文学. 2016
[17]基于耳石微化学的长江安徽和县江段刀鲚生境履历重建. 李孟孟,姜涛,KHUMBANYIWA Davison Daniel,刘洪波,杨健. 2017
[18]溯河洄游长江刀鲚(Coilia nasus)摄食虾类的调查. 姜涛,刘洪波,李孟孟,杨健. 2018
[19]长江口刀鲚渔汛特征及捕捞量现状. 刘凯,段金荣,徐东坡,张敏莹,方弟安,施炜纲. 2012
[20]运输应激对刀鲚生理生化指标和HPI轴基因表达影响及甘草甜素的作用. 高金伟,杜富宽,顾若波,徐钢春. 2015
作者其他论文 更多>>
-
大口黑鲈室内工厂化全季节苗种培育及驯化技术
作者:朱昊俊;张红英;徐钢春;许爱国;强俊;张茂友
关键词:
-
大口黑鲈amh基因全长cDNA克隆、表达及多克隆抗体制备
作者:李兵部;曹哲明;陶易凡;徐钢春;许爱国;李鸣霄;张红英;陈诗扬;强俊;徐跑
关键词:amh;基因克隆;组织表达;多克隆抗体;性腺发育;大口黑鲈
-
蟹塘混养鲈鱼 亩增收5000元以上
作者:张茂友;陈文华;强俊;徐钢春;朱昊俊
关键词:
-
饲料中添加刺五加对吉富罗非鱼脂质沉积、抗氧化能力及肠道消化酶和微生物的影响
作者:李全杰;朱昊俊;强俊;聂志娟;高建操;孙毅;徐钢春
关键词:刺五加;生长;肠道微生物;吉富罗非鱼
-
壳聚糖/乳酸链球菌素复合抗菌膜的制备及其性能
作者:胡瀚文;余雪健;李旭;陈喆;贾雪岩;唐雪;徐钢春;陆乃彦
关键词:壳聚糖;乳酸链球菌素;京尼平;复合膜;包装材料
-
基于体形指标的加州鲈选育技术
作者:强俊;徐钢春;王庆春;徐跑
关键词:
-
不同养殖阶段的大口黑鲈肠道结构和肠道微生物组成变化的比较
作者:李鸣霄;强俊;徐钢春;周国勤;张茂友;陶易凡;路思琪;李岩;陆健;徐跑
关键词:大口黑鲈;苗种培育;食性转变;肠道结构;肠道微生物