文献类型: 中文期刊
作者: 孟超敏 1 ; 耿翡翡 1 ; 卿桂霞 1 ; 张富厚 1 ; 李雪林 1 ; 刘逢举 2 ;
作者机构: 1.河南科技大学农学院
2.中国农业科学院棉花研究所
关键词: 陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 浙江农林大学学报
ISSN:
年卷期: 2023 年 004 期
页码: 723-730
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解析棉花GhGDPD1基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。图7表1参18
- 相关文献
[1]陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,李雪林,张富厚,刘逢举. 2023
[2]棉花GhDMT7基因对5-氮杂胞嘧啶核苷的响应机制. 杨志宁,陆许可,范亚朋,孙玉平,喻欣,王亮,高永健,古丽加依那什·哈不力,古丽沙西·拿斯依,吾木尔·阿不都,黄慧,张梦豪,王立东,陈筱,肖磊,张鑫蕊,王帅,陈修贵,王俊娟,郭丽雪,高文伟,叶武威. 2025
[3]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020
[4]海岛棉耐盐相关基因GbPLA1-32的克隆及生物信息学分析. 张红,张悦新,徐楠,芮存,范亚朋,王晶,韩明格,王琴琴,孙亮庆,陈修贵,陆许可,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,赵兰杰,陈超,陈全家,叶武威. 2024
[5]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018
[6]鸡Fnip1基因克隆、组织表达及生物信息学分析. 黄正洋,孔令琳,王钱保,李春苗,吴兆林,黄华云,赵振华. 2025
[7]小麦TaSRG1基因的克隆、生物信息学分析及表达特征. 徐灵,洪鼎立,邓云颢,徐如宏,李鲁华. 2024
[8]棉花DNA甲基转移酶GhDMT9抗逆性分析. 杨笑敏,杨笑敏,芮存,张悦新,王德龙,王俊娟,陆许可,陈修贵,郭丽雪,王帅,陈超,叶武威. 2019
[9]棉花GhUGT75L6的生物信息学分析及功能验证. 王心蕾,王心蕾,陆许可,陈修贵,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,陈超,叶武威. 2021
[10]棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析. 叶武威,叶武威. 2019
[11]陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证. 王琴琴,陈修贵,陆许可,王帅,张悦新,范亚朋,陈全家,叶武威. 2022
[12]陆地棉GhPYR1基因的克隆和功能分析. 刘妍,孟志刚,孙国清,王远,周焘,郭三堆,张锐. 2016
[13]陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析. 王俊娟,郭丽雪,陆许可,阴祖军,王德龙,陈修贵,王帅,樊伟丽,陈超,叶武威. 2018
[14]棉花光籽基因n2的精细定位. 李思敏,宋国立. 2019
[15]陆地棉TLP基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 张华崇,张文蔚,简桂良,李蔚. 2019
[16]陆地棉MADS-box家族基因鉴定及组织特异性表达分析. 张爱,张爱,王彩香,宿俊吉,张先亮,史春辉,刘娟娟,彭云玲,马雄风. 2020
[17]棉花中GhTFL1a和GhTFL1c基因的表达及启动子分析. 张晓红,胡根海,王寒涛,王聪聪,魏恒玲,付远志,喻树迅. 2019
[18]紫云英LEAFY基因的克隆与鉴定. 张贤,王建红,曹凯,庄俐,曹卫东. 2018
[19]苎麻BnNRT1.1基因的克隆及表达特性研究. 侯美,高钢,朱爱国,陈平,陈继康,陈坤梅,熊和平,喻春明. 2018
[20]紫花苜蓿BAN基因的克隆及其生物信息学分析. 王学敏,董洁,姜霁珊,王赞,高洪文. 2012
作者其他论文 更多>>
-
陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析
作者:孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;李雪林;张富厚;刘逢举
关键词:陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;表达分析
-
微波炉烘干棉花叶片用于DNA提取的效果分析
作者:付小琼;付小琼;李超;刘逢举;刘媛;彭军
关键词:微波炉烘干;DNA;棉花;叶片
-
不同基因型棉花苗期耐磷性评价及鉴定指标筛选
作者:孟超敏;孟超敏
关键词:棉花;苗期;耐磷性;指标
-
低磷胁迫下不同基因型棉花生理和形态的响应差异
作者:孟超敏;孟超敏
关键词:棉花;低磷胁迫;磷利用效率;变异系数
-
利用SSR分子标记构建邯棉559、邯棉802和邯郸885的指纹图谱
作者:付小琼;杨保新;杨付新;刘逢举;刘媛;蔡家滨;彭军
关键词:邯棉559;邯棉802;邯郸885;SSR;指纹图谱;纯度
-
基于DNA-SSR分析2015年度我国主推棉花杂交种纯度
作者:杨付新;彭军;刘逢举;刘媛
关键词:棉花;杂交种;SSR;纯度检测;分子鉴定
-
皮棉产量与衣分等性状间的相关性研究
作者:刘逢举;金石桥;杨付新;刘媛
关键词:皮棉产量;衣分等性状;GGE双标图;正相关性




