您好，欢迎访问中国农业科学院 机构知识库！

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

蜡状芽胞杆菌群三大类全基因组序列的同源性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭刚 1 ; 马琪奇 2 ; 李炫 3 ; 曾会才 1 ; 刘正初 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站/香蕉研究所

2.华中农业大学生命科学技术学院

3.中国农业科学院麻类研究所

关键词： 蜡状芽胞杆菌群;全基因组;基因组装配

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2010 年 29 卷 05 期

页码： 186-190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 全基因组比对一般采用全基因组范围内的序列比对,本文首次采用单基因在全基因组范围内进行基因排列比对,选取了蜡状芽胞杆菌群中的44个必须基因,在该群中3大类共5个(Bt.97-27,Bc.14579,Bc.10987,Bc.E33L和Ba.Ames Ancestor)全基因组进行横向比对,所有基因在各个基因组中的排列顺序完全一致,少有交叉,进一步证明:在蜡状芽胞杆菌群中,特别是在蜡状芽胞杆菌、苏云金芽胞杆菌和炭疽芽胞杆菌之间,存在相当大的基因相似性,这与前人的研究结果一致。这种相似性有利于将来用于在该群中所有菌株的全基因组测序装配中。

  • 相关文献

[1]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[2]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010

[3]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010

[4]口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较. 吕律,杨帆,何继军,靳野,郭建宏,郑海学,刘湘涛. 2014

[5]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017

[6]“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析. 陶晓丽,马利超,聂斌,王彦荣,刘志鹏. 2017

[7]长三角地区兼用型鸭全基因组遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫,刘怡. 2017

[8]马铃薯StIgt基因家族的鉴定及其对干旱胁迫的响应分析. 秦天元,刘玉汇,孙超,毕真真,李安一,许德蓉,王一好,张俊莲,白江平. 2021

[9]口蹄疫病毒OT株的全基因组序列测定及比较分析. 吕占禄,王光祥,尚佑军,刘湘涛. 2012

[10]犬细小病毒JL-M13株分离鉴定及全基因组序列分析. 仝明薇,易立,程世鹏,孙长英,王文宪. 2014

[11]A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列的测定及其基因特征分析. 谢毅,牟一娇,朱琳,刘强,赵兴绪. 2013

[12]鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析. 黄云秀,李传峰,孟春春,陈宗艳,李露,宋凯杰,刘光清,韦天超. 2015

[13]大白菜InDels标记开发及其在剩余杂合体鉴定中的应用. 张志刚,赵智中,李巧云,王晓,刘栓桃,王淑芬,徐文玲,刘贤娴,刘辰. 2016

[14]貉源阿留申病毒全基因组测序及末端序列分子特征分析. 赵永强,吴艳虹,章秀婷,韦韬,丛丽,邵西群. 2021

[15]基于CRISPR/Cas9技术的全基因组基因编辑MDCK细胞文库的构建. 朱媛媛,许榜丰,闫鸣昊,刘芹防,滕巧泱,苑纯秀,李雪松,李泽君. 2024

[16]鸡J亚群禽白血病病毒AH-J11株的全基因组感染性克隆构建. 王蓓,刘芳,王汉清,李宁,魏建忠,刘光清,王桂军. 2013

[17]全基因组DNA甲基化图谱及其在动物遗传育种中的研究进展. 赵敬贤,张路培,高会江,李俊雅,许尚忠,高雪. 2013

[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离及其基因组变异特征的研究. 王青,徐彦召,王磊,张慧辉,张文举. 2016

[19]口蹄疫OX株全基因组cDNA的分子克隆、序列测定及分析. 孙世琪,郭慧琛,尚佑军,魏旭文,靳野,马军武,韩雪清,刘湘涛,谢庆阁. 2004

[20]甘肃地区一株PCV-3流行毒株的全基因序列测定及遗传演化分析. 张辉,马雪青,袁红,李勇生,魏达礼,卢曾军,刘在新,韩庆彦,孙普. 2023

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台