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普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李园 1 ; 常玉洁 1 ; 王兰芬 1 ; 王述民 1 ; 武晶 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 普通菜豆;镰孢菌枯萎病;全基因组关联分析;抗性基因/种质资源

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 51-61

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 普通菜豆镰孢菌枯萎病是严重制约菜豆（Phaseolus vulgaris）产量的主要病害之一。采用下胚轴双孔注射法对601份普通菜豆种质资源进行枯萎病抗性鉴定,共筛选出4份高抗材料。在此基础上,基于分布在全基因组上的3 765 456个单核苷酸多态性（SNP）标记,进行全基因组关联分析,以P＜1×10–5为阈值。结果检测到57个显著关联的SNP位点,分布于1、2、6、8和11号染色体上;共获得8个显著关联区域,其中位于1号染色体上的区域1包含SNP最多（48个）,最显著SNP P值为2.18E–07。在8个显著关联区域中,共检测到186个基因,其中157个基因有注释信息,编码过氧化物酶、抗病蛋白、转录因子和蛋白激酶等。结合KEGG富集分析和序列同源性比对,鉴定出9个候选基因可能与抗性相关。

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[17]普通菜豆新品种中芸8号. 王兰芬,武晶,常玉洁,王述民. 2022

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