您好，欢迎访问中国农业科学院 机构知识库！

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

绵羊肺炎支原体GH3-3株全基因组测序及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 田彤彤 1 ; 葛家振 1 ; 高鹏程 1 ; 李学瑞 1 ; 宋国栋 1 ; 郑福英 1 ; 储岳峰 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室

关键词： 绵羊肺炎支原体;GH3-3株;全基因组测序;毒力因子;耐药基因

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 007 期

页码： 323-334

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3株的基因序列，研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制。【方法】采用体外培养，利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组DNA，进行全基因组测序。【结果】绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组大小为1 060 772 bp，GC含量为29.66%，基因组组分分析后发现，GH3-3株的基因组含有730个编码基因，总长度为914 379 bp，平均长度为1 252.57 bp，占基因组全长的86.2%。串联重复序列共149个，总长为20 926 bp，占基因组全长的1.97%。微卫星DNA序列102个，tRNA 30个，rRNA 3个。在NR、SwissProt、GOG、KEGG、GO、CARD、CAZy、PHI、TCDB、RMS数据库中，分别有719、459、473、394、449、33、5、180、113、59个基因被注释；在VFDB数据库中，共注释到了76个毒力因子相关的基因。将基因组序列提交至NCBI网站，获得登录号为：PRJNA1051969。【结论】获得了绵羊肺炎支原体GH3-3株完整的基因组信息，预测和注释了其基因的功能，明确了GH3-3株以及与国内外其他绵羊肺炎支原体菌株之间的遗传进化关系。

  • 相关文献

[1]1株鸡源奇异变形杆菌的全基因组测序及生物信息学分析. 茹梦珂,李穗湘,吴雪琴,严钰璋,王璐,程海鹏. 2025

[2]江苏省部分地区畜禽源弯曲菌耐药基因、毒力基因及遗传多样性分析. 唐梦君,周倩,张小燕,唐修君,陆俊贤,陈薇,高玉时. 2025

[3]一株松鼠猴源粪肠球菌的分离鉴定及耐药性分析. 刘永安,储岳峰,马丽娜,周建华,李学瑞,刘永生. 2017

[4]一株羊源致病性屎肠球菌的分离鉴定及耐药性分析. 刘永安,李学瑞,周建华,马丽娜,刘永生. 2017

[5]牛源金黄色葡萄球菌耐药性与相关耐药基因和菌株毒力基因的相关性研究. 杨峰,王旭荣,李新圃,罗金印,刘龙海,张哲,王玲,张世栋,李宏胜. 2016

[6]仔猪感染大肠杆菌特性分析. 姜成刚,安同庆,王淑杰,蔡雪辉. 2014

[7]乳源无乳链球菌的分离鉴定、耐药与毒力特征及基因组分析. 高姣姣,郑楠,邵伟,陈贺,马宪兰,赵艳坤. 2025

[8]MG-S6株MGA0553基因的功能研究初探. 高继业,扬州大学兽医学院,丁铲,高勤学,陈鸿军. 2007

[9]水貂志贺氏菌分离鉴定及药物敏感性分析. 孙娜,陈强,程世鹏. 2017

[10]绵羊肺炎支原体多表位疫苗的研究及免疫试验. 张轩. 2013

[11]绵羊肺炎支原体p74基因重组单核细胞增生李斯特菌的构建及其免疫原性分析. 卢海亭,乔军,孟庆玲,彭叶龙,陈诚,田路路,贡莎莎,才学鹏,陈创夫. 2017

[12]绵羊肺炎支原体间接ELISA检测方法的建立及应用. 赵萍,储岳峰,高鹏程,贺英,赵海燕,逯忠新. 2008

[13]绵羊肺炎支原体间接血凝诊断方法的建立. 赵萍,逯忠新,储岳峰,高鹏程,贺英,石琴. 2008

[14]绵羊肺炎支原体免疫蛋白质组学的初步研究. 许健,储岳峰,高鹏程,赵萍,贺英. 2012

[15]绵羊肺炎支原体荚膜多糖的提取纯化及反应原性分析. 田彤彤,葛家振,李倩倩,高鹏程,吴晓妮,宋国栋,刘一健,郑福英,储岳峰. 2024

[16]绵羊肺炎支原体最适培养基的筛选. 许健,储岳峰,赵萍,高鹏程,贺英,剡根强,逯忠新. 2011

[17]绵羊肺炎支原体延伸因子EF-P基因的克隆、表达及其重组蛋白免疫原性研究. 田路路,孟庆玲,乔军,于伟伟,孟丹,李重阳,才学鹏,陈创夫. 2017

[18]绵羊肺炎支原体小鼠感染模型的建立. 杜改梅,王月,茅慧华,雷卫强,储岳峰,刘茂军. 2024

[19]中国部分地区绵羊肺炎支原体的基因多态性分析. 许健,储岳峰,赵萍,高鹏程,贺英,剡根强,逯忠新. 2011

[20]绵羊肺炎支原体新疆流行株的分离鉴定及其膜蛋白P80基因序列分析. 马玉,乔军,孟庆玲,刘田莉,胡政香,陈诚,才学鹏,张金生,陈创夫. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台