文献类型： 中文期刊

作者： 刘浩然 ¹ ; 张晨禹 ¹ ; 龚洋 ¹ ; 叶圆圆 ¹ ; 陈杰丹 ¹ ; 陈亮 ¹ ; 刘丁丁 ¹ ; 马春雷 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院茶叶研究所/农业农村部特种经济动植物生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 茶树;mSNP分子标记;靶向测序基因型检测;遗传多样性;全基因组重测序

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2023 年 43 卷 001 期

页码： 27-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测.结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具有亲缘关系或地理位置接近的资源聚在一起的趋势;对重测序数据进行功能注释后发现,在18份白化茶树资源中存在17056个共有非同义突变基因,其中14个叶绿素合成相关基因中存在98个错义突变位点.随后,基于前期获得的基因组变异信息开发了一套包含59个mSNP、222个SNP位点的液相芯片,利用该液相芯片检测13份茶树资源的基因型信息.结果表明,同一品种两两之间的遗传相似度在92%~98%,不同品种间的遗传相似度则在84%以下,表明该芯片可对18份白化茶树资源进行准确鉴别,研究结果可为mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定、分子标记辅助育种等方面的应用奠定基础.