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水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1的SNP区域在地方品种中的变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘畅媛 1 ; 孙一丁 2 ; 马继琼 2 ; 杨奕 2 ; 汤翠凤 2 ; 阿新祥 2 ; 郭怡卿 3 ; 许明辉 2 ;

作者机构: 1.云南农业大学植保学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

3.云南农业大学植物保护学院

关键词: 水稻;种质资源;稻瘟病;抗性基因;单倍型

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 2097-2102

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为揭示地方水稻品种中稻瘟病持久抗性基因Bsr-d1序列变异类型,本研究以收集到的缅甸、老挝和越南共79份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病Bsr-d1基因特异引物对Bsr-d1基因启动子功能位点区段进行PCR扩增及测序分析。研究表明,79份地方水稻均持有抗稻瘟病Bsr-d1或bsr-d1等位基因,品种间存在18个变异位点和22个碱基的差异,根据差异所有品种可归为6种单倍型,其中H4和H6为优势单倍型,分别占测试品种的20.25%、58.23%;6种单倍型中仅H3单倍型携带抗性位点,有8个材料归为此类型,占10.13%。缅甸地方品种拥有H120(15.79%)、H220(2.63%)、H320(13.16%)、H420(18.42%)、H620(50%)等5种单倍型,优势单倍型为H6;老挝地方品种有H120(2.56%)、H320(7.69%)、H420(23.08%)、H520(2.56%)、H620(64.10%)205种单倍型,H6为优势单倍型,表明缅甸、老挝间在单倍型种类和抗性品种比例上均存在一定差异。本研究结果表明缅甸、老挝水稻资源携带持久抗性基因Bsr-d1的品种比例远高于中国品种,对中国选育稻瘟病持久抗性品种具有重要的利用价值,应加强对该地区种质的引进和分析评价。

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