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大豆种子蛋白质组样品制备与数据分析方法

文献类型： 中文期刊

作者： 牟永莹 1 ; 王道平 1 ; 陈明 1 ; 邱丽娟 1 ; 潘映红 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 蛋白质组;样品制备;蛋白酶切;大豆种子

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2020 年 36 卷 012 期

页码： 247-255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 构建一种适用于大豆种子蛋白质组样品制备与液相质谱分析的技术体系,为深入研究大豆蛋白组学创造条件.以大豆品种中黄35成熟期种子为材料,分别对常用的蛋白质提取、酶切、液相分离梯度和数据库进行比较分析.结果表明,使用改进的尿素硫脲蛋白提取法配合赖氨酸C端内切酶/胰蛋白酶顺序酶切法制备的质谱分析样品,经90 min纳升级液相梯度分离和质谱分析,最后采用UniProt数据库解谱时,大豆种子蛋白鉴定数目最多.将此方法应用于大豆品种十胜长叶成熟种子样品制备和分析,3次样品制备重复试验共鉴定非冗余蛋白2244组,其中61%蛋白质可被重复鉴定.该方法具有一定的可靠性和稳定性,适用于大豆种子蛋白质组样品制备和数据分析.

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