文献类型： 中文期刊
作者： 宿洋 1 ; 杨静 2 ; 郭勇 2 ; 杜维俊 1 ; 邱丽娟 2 ;
作者机构： 1.山西农业大学农学院
2.中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程/农业农村部北京大豆生物学重点实验室
关键词： 大豆;百粒重;同源基因;SNP;重测序
期刊名称： 作物杂志
ISSN：
年卷期： 2021 年 003 期
页码： 8-18
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 百粒重是大豆重要的产量性状之一,利用正向和反向遗传学方法鉴定与籽粒大小/粒重相关的基因具有重要的理论和实践意义。利用拟南芥和水稻等模式植物中已明确功能的调控籽粒大小/粒重的基因,基于序列相似和结构域相同的原则,在大豆全基因组内筛选到175个同源基因,通过基因表达谱分析发现有22个基因在大豆种子中特异性表达。利用56份大豆种质资源重测序数据查找这些基因内的SNP位点,共得到2769个SNP位点,从中筛选得到在野生大豆和栽培大豆中分化明显的SNP位点121个。通过扩增测序对其中的16个导致非同义变异的SNP位点进行验证,发现有5个SNP位点在野生大豆中为一种变异,而在栽培大豆中为另一种变异。利用2368份大豆种质资源的重测序数据获得了其中的4个SNP位点的变异数据,结合其中1695份材料的百粒重表型分析,发现每个SNP位点对应的野生和突变基因型材料的百粒重表型间都存在极显著差异,并且每个SNP位点中野生基因型材料的百粒重大部分≥12g,突变基因型材料的百粒重大部分<12g,因此上述4个SNP位点所在的基因（Glyma.05G019800、Glyma.07G022800、Glyma.13G259700和Glyma.13G261700）可能与大豆籽粒大小/粒重的调控有关。获得了与大豆百粒重相关的4个候选基因,为大豆百粒重QTL的精细定位和功能标记的开发以及调控大豆籽粒大小/粒重的基因的功能研究提供了参考。
- 相关文献
[1]基于重测序的烟草赤星病抗性关联SNP位点挖掘. 王文静,王凤龙,焦芳婵,孙光军,宋光龙,陈风雷,王卫民,吴晶晶,王晓强. 2023
[2]群体构成方式对大豆百粒重全基因组选择预测准确度的影响. 马岩松,刘章雄,文自翔,魏淑红,杨春明,王会才,杨春燕,卢为国,徐冉,张万海,吴纪安,胡国华,栾晓燕,付亚书,王曙明,韩天富,张孟臣,张磊,苑保军,郭勇,Jochen C.REIF,江勇,李文滨,王德春,邱丽娟. 2018
[3]基于高密度Bin图谱的大豆百粒重QTL定位和候选基因分析. 葛天丽,田宇,张皓,刘章雄,李英慧,邱丽娟. 2022
[4]大豆遗传图谱的构建及若干农艺性状的QTL定位分析. 宛煜嵩. 2002
[5]大豆抗胞囊线虫病种质rhg_1和Rhg_4位点的单核苷酸多态性(SNPs). 邱丽娟,常汝镇,王文辉,Perry Cregan,Dechun Wang,Yiwu Chen,马凤鸣. 2003
[6]一种大豆SNP分型新方法. 袁翠平,李英慧,刘章雄,关荣霞,常汝镇,邱丽娟. 2007
[7]应用SNP精准鉴定大豆种质及构建可扫描身份证. 魏中艳,李慧慧,李骏,Yasir A.Gamar,马岩松,邱丽娟. 2018
[8]栽培大豆×半野生大豆高密度遗传图谱构建及株高QTL定位. 于春淼,张勇,王好让,杨兴勇,董全中,薛红,张明明,李微微,王磊,胡凯凤,谷勇哲,邱丽娟. 2022
[9]低磷胁迫下大豆苗期根系性状全基因组关联分析. 孙畅,刘美玲,刘子君,杨光,梁腾月,周宣汝,赵悦如,张洛桐,谷勇哲,敖雪. 2024
[10]变性高效液相色谱技术在检测猪未知多态方面的研究. 王焕岭,王恒,朱正茂,杨述林,任红艳,冯书堂,李奎. 2005
[11]大豆胞囊线虫抗病候选基因rhg1多样性及分子标记开发与利用. 南海洋. 2010
[12]抗大豆胞囊线虫候选基因的发掘及CAPS标记开发. 史学晖. 2015
[13]蒺藜苜蓿花器官特异基因的表达分析. 马利超,王彦荣,刘志鹏. 2012
[14]我国羊泰勒虫病快速诊断方法成环恒温扩增法的研制. 刘志杰,侯俊玲,MohammedA.Bakheit,DiaeldinA.salih,罗建勋,殷宏,JabbarS.Ahmed,UlrikeSeitzer. 2009
[15]几份甘蓝杂种致死材料的重测序分析. XIAO Zhi-liang,肖志亮,胡阳,HU-Yang. 2016
[16]两个大白菜DREB2A基因的基因组解析. 李利斌,李化银,刘立峰,高建伟. 2011
[17]Opaque2基因对糯玉米子粒品质的影响分析. 周昱婕,韩洁楠,王美娟,刘晓丽,李明顺. 2021
[18]中国重要玉米自交系种质资源子粒性状特征分析. 李鑫,李永祥,吴迅,白娜,宋燕春,张登峰,王天宇,黎裕,石云素. 2016
[19]干旱胁迫后玉米杂交种产量性状与抗旱性的关系研究. 唐怀君,刘成,孙宝成,王天宇,黎裕,石云素,宋燕春. 2012
[20]野生大豆天然群体百粒重类型组成与地理分布调查. 王克晶,李向华,张志卫,李福山,曹永生. 2005
作者其他论文 更多>>
-
大豆种质资源时序性冠层覆盖度鉴定评价及优异种质筛选
作者：王琦;白东;张皓;田宇;车荧璞;李进冬;郑海洋;金秀良;李英慧;邱丽娟
关键词：大豆;种质资源;时序性;最大冠层覆盖度;封垄速度
-
大豆分枝数QTL定位及候选基因筛选
作者：胡蒙;沙丹;张晟瑞;谷勇哲;张世碧;李静;孙君明;邱丽娟;李斌
关键词：大豆;分枝数;重组自交系;QTL定位;候选基因
-
大豆不饱和脂肪酸含量全基因组关联分析
作者：赵祥光;张皓;冯新康;王琦;孙大千;储丽;李英慧;杜吉到;邱丽娟
关键词：大豆;不饱和脂肪酸;全基因组关联分析;GmFAD3A;功能位点
-
基于改进RT-DETR的轻量化豆荚检测模型
作者：刘亿琳;卢承方;黄岚;詹炜;王俊;邱丽娟
关键词：豆荚识别;计算机视觉;RT-DETR;轻量化;深度学习
-
大豆萌发期耐盐性鉴定方法建立及耐盐大豆资源筛选
作者：刘欣玥;郭潇阳;王欣茹;辛大伟;关荣霞;邱丽娟
关键词：大豆;种质资源;萌发期;耐盐性鉴定
-
大豆根茎过渡区弯曲突变体Mrstz的鉴定与基因定位
作者：苗龙;舒阔;李娟;黄茹;王业杏;Soltani Muhammad YOUSOF;许竞好;吴传磊;李佳佳;王晓波;邱丽娟
关键词：大豆;根茎过渡区;突变体;BSA-seq;候选基因
-
基于国内外大豆品种比较的中国大豆品种改良路径探索
作者：郭勇;姜思琦;于莉莉;徐江源;洪慧龙;邱丽娟
关键词：大豆;品种改良;高油高产;路径
