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苹果坏死花叶病毒实时荧光定量PCR检测体系的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 胡国君 1 ; 张尊平 1 ; 范旭东 1 ; 任芳 1 ; 马勉娣 2 ; 张秀英 2 ; 鲁兴凯 2 ; 董雅凤 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院果树研究所国家落叶果树脱毒中心

2.昭通市苹果产业发展中心

关键词: 苹果;苹果坏死花叶病毒;实时荧光定量PCR;常规PCR

期刊名称: 中国果树

ISSN: 1000-8047

年卷期: 2021 年 005 期

页码: 13-17

收录情况: 北大核心

摘要: 根据GenBank数据库已登录序列设计了12对苹果坏死花叶病毒(apple necrotic mosaic virus,ApNMV)的检测引物,通过引物筛选和体系优化,建立了以ApN1-F3/R3为引物的ApNMV的TB Green染料法实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测技术。该技术标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,扩增效率为97.3%,相关系数为0.997,灵敏度是常规PCR的100倍。采用q PCR方法对60份田间苹果样品进行检测,结果显示,常规PCR对ApNMV的检出率为51.7%,而qPCR的检出率为56.7%。该技术适用于田间样品的检测。

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