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葡萄蚕豆萎蔫病毒中国分离物基因组全长序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张宝东 1 ; 范旭东 1 ; 张尊平 1 ; 任芳 1 ; 胡国君 1 ; 李晨 1 ; 贾晓君 1 ; 董雅凤 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院果树研究所国家落叶果树脱毒中心

关键词: 葡萄;葡萄蚕豆萎蔫病毒;基因组;序列分析

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2022 年 004 期

页码: 601-612

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus, GFabV)是近年报道的葡萄新病毒,与葡萄褪绿斑驳、皱缩等症状发生相关,严重影响葡萄长势。本研究采用小RNA测序结合Sanger测序方法分别对表现褪绿斑驳的‘贝达’和无症状的‘赤霞珠’葡萄中的GFabV分离物进行基因组全长序列测定,获得了GFabV分离物LN_BETA2和LN_CXZ的基因组全长序列,其RNA1基因组全长分别为5 824 bp和5 823 bp, RNA2基因组全长分别为3 132 bp和3 135 bp。LN_BETA2与LN_CXZ的RNA1编码的多聚蛋白核苷酸序列之间的同源性为81.7%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性分别为73.4%~99.5%和73.5%~82.5%;LN_BETA2和LN_CXZ的RNA2编码的多聚蛋白核苷酸同源性为83.8%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性为75.0%~83.3%和68.2%~98.6%。系统进化树分析结果显示,在RNA1基因组中,LN_BETA2划分在组3,LN_CXZ形成单独的分支。RNA2基因组中,LN_BETA2和LN_CXZ分别划分在组3和组5中。本研究首次报道了GFabV中国分离物基因组全长序列,可为今后GFabV生物学特性及致病性研究提供工作基础。

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