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基于Smart-seq2技术探究玻璃化冷冻对牛活检囊胚基因表达的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 董建华 1 ; 杨柏高 2 ; 张笑梦 2 ; 冯肖艺 2 ; 赵学明 3 ; 吕丽华 2 ;

作者机构: 1.山西农业大学动物科学学院

2.山西农业大学动物科技学院

3.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词: Smart-seq2技术;牛囊胚;玻璃化冷冻;胚胎活检;转录组测序

期刊名称: 浙江大学学报(农业与生命科学版)

ISSN: 1008-9209

年卷期: 2025 年 51 卷 005 期

页码: 754-766

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究胚胎活检及后续玻璃化冷冻处理对牛体外受精囊胚基因表达的影响,以牛体外囊胚为研究对象,设置新鲜组(未经任何体外操作的原始胚胎)、活检组(经滋养外胚层活检的胚胎)、活检后玻璃化冷冻组(活检后的胚胎经玻璃化冷冻保存),每组选取3枚形态良好的囊胚,利用Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术进行转录组分析,并在基因本体(gene ontology, GO)数据库及京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)中进行富集分析。结果表明:与新鲜组相比,在活检组中共鉴定到1 083个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),GO和KEGG富集分析显示,这些DEGs与细胞脂质代谢过程、葡萄糖稳态、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关;相较于新鲜组,在活检后玻璃化冷冻组中共鉴定到1 391个DEGs,主要富集于糖异生、全局代谢通路及氨基酸合成等生物学过程;与活检组相比,在活检后玻璃化冷冻组中共鉴定到824个DEGs,主要与丙酮酸代谢、N-聚糖生物合成、细胞衰老等相关。综上所述,本研究基于Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术揭示了玻璃化冷冻对活检后牛体外囊胚脂质代谢、能量代谢、MAPK信号通路等相关基因表达的影响,为优化牛胚胎冷冻保存技术、提升良种胚胎利用率提供了分子靶点与理论依据。

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