文献类型: 中文期刊
作者: 付立芳 1 ; 张航 2 ; 吕文琼 3 ; 韩星 4 ; 邹琳 5 ;
作者机构: 1.重庆医科大学附属儿童医院临床分子医学中心/儿童发育疾病研究教育部重点实验室/国家儿童健康与疾病临床医学研究中心/儿童发育重大疾病国家国际科技合作基地/重庆市干细胞治疗工程技术研究中心
2.四川省雅安市人民医院检验科
3.成都市第三人民医院实验医学科临床检验部
4.四川大学华西第二医院小儿血液肿瘤科
5.西安市儿童医院检验科
关键词: hsa_circ_0004123;绝对荧光定量PCR;白血病
期刊名称: 解放军医学杂志
ISSN: 0577-7402
年卷期: 2019 年 11 期
页码: 906-911
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 目的建立能精确定量hsa_circ_0004123的绝对反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)方法,并在白血病细胞系中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。方法提取B淋巴母细胞系HMy2.CIR总RNA,反转录合成cDNA。以cDNA为模板,扩增包含hsa_circ_0004123反向剪接位点的236 bp特征片段,克隆到pGM-T载体中,并对重组质粒进行测序鉴定。以梯度稀释的重组质粒为标准品,采用SYBR荧光染料法进行RT-qPCR并建立标准曲线,在4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。结果建立了能精确定量hsa_circ_0004123拷贝数的绝对RT-qPCR方法,其线性范围为(9.63×103~9.63×109)拷贝/μl,灵敏度为(4528±516)拷贝/μl,批内变异系数(CV)为0.30%~1.86%,批间CV为1.40%~2.30%,且熔解曲线为单一峰值曲线。对4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中hsa_circ_0004123的拷贝数分别用本法进行检测,结果显示,hsa_circ_0004123在4种白血病细胞系中的表达差异有统计学意义(P<0.001)。结论建立的检测hsa_circ_0004123的绝对RT-qPCR方法具有线性范围广,灵敏度、特异性高,重复性好等特点,可为hsa_circ_0004123在白血病中的精确定量提供技术支持。
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