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陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证

文献类型: 中文期刊

作者: 王琴琴 1 ; 陈修贵 1 ; 陆许可 1 ; 王帅 1 ; 张悦新 1 ; 范亚朋 1 ; 陈全家 1 ; 叶武威 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学农学院教育部棉花工程研究中心;中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室

关键词: 陆地棉;GhPKE1;生物信息学分析;VIGS

期刊名称: 中国农业科技导报

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2022 年 01 期

页码: 38-45

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花。结果表明,GhPKE1基因序列全长1 048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56。分别用硫酸钠(Na_2SO_4)和氯化镉(CdCl_2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异。qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na_2SO_4和抗CdCl_2性显著减弱。综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础。

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